Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1041755	1041759	5	69 [0]	[0] 49	appA	phosphoanhydride phosphorylase

AGATATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTCA  >  W3110S.gb/1041760‑1041824 |                                                                 agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:59509/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:244512/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:303119/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:36531/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:381010/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:424324/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:441312/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:45262/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:481688/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:538336/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:541406/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:562517/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:58676/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1784109/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:700195/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:717385/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:719425/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:726449/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:773221/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:778602/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:813159/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:837330/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:911420/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:916801/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:971355/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1473569/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1062238/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1126804/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1185724/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1204336/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1259752/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1263122/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1278155/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1364289/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1412767/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1416350/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1471052/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1028449/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1476330/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:149593/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:150169/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1531950/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:153279/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1579498/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:161778/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1656381/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1706919/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1739869/65‑1 (MQ=255) agaTATTTCTCCTGAAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTca  <  1:1592619/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AGATATTTCTCCTGCAACAAGCACAGGGAATGCCGGAGCCGGGGTGGGGAAGGATCACCGATTCA  >  W3110S.gb/1041760‑1041824

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑