Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1132766	1132798	33	28 [0]	[0] 64	flgB	flagellar component of cell‑proximal portion of basal‑body rod

CTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACGG  >  W3110S.gb/1132701‑1132765                                                                 | cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:1689847/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:980948/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:714295/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:712019/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:702745/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:671889/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:574297/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:407105/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:391367/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:317901/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:258011/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:203554/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:201270/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:1763659/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:1021634/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:1671460/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:1665650/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:1616509/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:1594095/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:1590674/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:1544976/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:15245/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:1505665/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:146501/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:1431711/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:1387178/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:116805/1‑65 (MQ=255) cTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACgg  >  1:1164866/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CTGGTTATCAGGCGCGCGATATCGATTTTGCCAGTGAACTTAAAAAAGTCATGCAACGTGGACGG  >  W3110S.gb/1132701‑1132765

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑