Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1274639 1274668 30 158 [0] [0] 29 chaC regulatory protein for cation transport

Only 100 of 158 total aligned reads displayed.

CTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAC  >  W3110S.gb/1274574‑1274638
                                                                |
gtGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:718407/64‑1 (MQ=255)
cTGATACTCTCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1741561/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCCGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:783921/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:281596/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:508488/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:415796/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:415563/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:409555/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:407461/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:373667/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:357974/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:353117/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:332128/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:317730/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:294592/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:567581/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:263622/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:234584/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:227474/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:224486/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:21598/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:194979/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:193640/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:186792/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1862017/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:100218/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:718654/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:961402/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:944039/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:943506/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:9179/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:917336/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:899464/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:794624/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:788242/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:773939/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:755734/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:745635/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:54859/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:699722/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:694947/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:682578/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:672515/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:667988/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:634956/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:627230/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:597291/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:596037/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1858134/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1247385/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1448958/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1845473/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1403874/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1371396/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1344949/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1335677/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1307547/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1305741/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1299868/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1282089/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1274297/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1431994/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1244881/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1225874/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:120830/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1207072/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1166279/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1154855/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1129025/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1107595/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1038170/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1035175/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1003359/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1705363/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1829124/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1825788/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1809549/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1794390/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1790446/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1730486/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1462639/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1700823/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1678233/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1617914/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1502868/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1521527/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:153040/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:158509/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1594466/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1612587/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1660444/65‑1 (MQ=255)
cTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATCGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1186774/65‑1 (MQ=255)
 tGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:761399/64‑1 (MQ=255)
 tGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1147010/64‑1 (MQ=255)
  gATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1539052/63‑1 (MQ=255)
       tCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1815045/58‑1 (MQ=255)
         gcgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:387137/56‑1 (MQ=255)
         gcgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1818814/56‑1 (MQ=255)
           gcTCAGGTGATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGGGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1868039/54‑1 (MQ=255)
                        cgcCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAc  <  1:1060210/41‑1 (MQ=255)
                                                                |
CTGATACTCGCGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAAC  >  W3110S.gb/1274574‑1274638

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: