Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1274639	1274668	30	158 [0]	[0] 29	chaC	regulatory protein for cation transport

CTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAACTGCT  >  W3110S.gb/1274669‑1274733 |                                                                 cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGATTGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:1128929/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:1209447/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:961628/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:954748/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:905464/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:844453/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:839199/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:748462/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:601243/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:466534/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:299972/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:297669/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:284262/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:241380/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:1822068/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:176837/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:1760282/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:1684553/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:1624645/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:1515677/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:1499839/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:1475868/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:1441091/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:1422706/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:1373353/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:1305137/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:1258968/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAActgct  <  1:1232749/65‑1 (MQ=255) cTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATATGCTGGAATCGGTAAAAAAActgct  <  1:965159/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CTTATCAAACTGGGAATGCAGGACGATGGGCTGAATGATTTGCTGGTATCGGTAAAAAAACTGCT  >  W3110S.gb/1274669‑1274733

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑