Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1827075 1827079 5 110 [0] [0] 35 spy envelope stress induced periplasmic protein

Only 100 of 110 total aligned reads displayed.

CTTCCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGT  >  W3110S.gb/1827012‑1827074
                                                              |
cttcGATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:407295/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCCGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:54431/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:360536/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:582138/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:578792/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:56345/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:466745/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:445172/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:422162/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:418902/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:412913/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:412689/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:371148/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:593287/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:339231/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:290249/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:272647/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:271542/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:260056/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:256043/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:213989/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:211382/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:205317/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1854971/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1021926/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:740026/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:99411/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:988327/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:987706/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:980749/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:957980/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:930275/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:915594/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:880246/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:810203/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:794616/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:772611/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:741015/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1846577/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:735422/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:734247/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:729677/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:714641/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:702634/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:686863/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:686193/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:642217/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:629700/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:629551/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:614271/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1161723/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1800724/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1374350/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1334639/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1332009/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1311268/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1246054/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1234221/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1228984/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1208545/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1185760/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:11746/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1162809/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1393037/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1158160/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1151130/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1117123/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1098959/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1097776/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:109468/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1090973/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:108628/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:107543/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1072133/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1070970/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1407392/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1752301/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1738767/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1729508/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1712211/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1687635/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1668367/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1647517/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1640414/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1632886/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1582531/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1582311/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1570441/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1560097/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1547664/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1526013/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:150458/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1497557/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1455451/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1442830/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1420918/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1395311/63‑1 (MQ=255)
cttcCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCATTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1565313/63‑1 (MQ=255)
    cATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:1540511/59‑1 (MQ=255)
      tttttGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGt  <  1:652868/57‑1 (MQ=255)
                                                              |
CTTCCATTTTTGCGATCTGCGCTTCAGCTTTTACTTTATCGAAGGTATCGCTGGCAATGATGT  >  W3110S.gb/1827012‑1827074

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑