Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1953219	1953756	538	36 [0]	[0] 47	yecE	conserved hypothetical protein

CGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCAC  >  W3110S.gb/1953154‑1953218                                                                 | ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:52874/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:244977/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:258900/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:27917/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:306891/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:39504/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:444629/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:471751/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:489163/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:227557/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:53901/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:598188/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:599892/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:643394/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:72241/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:845441/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:869961/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:999468/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:1688634/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:1115569/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:1171529/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:1269148/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:1296443/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:1320090/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:1502476/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:1588921/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:174488/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:1772484/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:1776932/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:1792064/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:1812966/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:206011/62‑1 (MQ=255) ctcttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTCTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:1820355/62‑1 (MQ=255) ctattGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:103662/62‑1 (MQ=255)    ttGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:1797454/62‑1 (MQ=255)             aCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcaccac  <  1:1400149/53‑1 (MQ=255)                                                                 | CGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCAC  >  W3110S.gb/1953154‑1953218

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑