Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1953219	1953756	538	36 [0]	[0] 47	yecE	conserved hypothetical protein

TTACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAT  >  W3110S.gb/1953757‑1953821 |                                                                 ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGCCCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:881969/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACTTACGCCAGACAt  >  1:183158/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACTTACGCCAGACAt  >  1:238205/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCa       >  1:1727220/1‑60 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACa   >  1:1005550/1‑64 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACa   >  1:238176/1‑64 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACa   >  1:491829/1‑64 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACa   >  1:1173427/1‑64 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:853093/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:101851/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:892617/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:872817/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:238421/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:271577/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:305513/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:307347/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:323749/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:82072/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:526930/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:56126/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:564891/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:62542/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:640462/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:766027/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:783344/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:810845/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:1825410/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:1020718/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:1065956/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:1112890/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:1179748/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:122174/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:13767/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:1422962/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:142373/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:1458337/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:1495144/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:1496589/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:1576162/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:1627300/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:1630686/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:1682212/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:1742011/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:1745023/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:1745594/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:1826695/1‑65 (MQ=255) ttACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTAACTTTTTTTACATACGCCAGACAt  >  1:993498/1‑65 (MQ=255) |                                                                 TTACAAAAATTAGCGCAGTGGCATCAGACCACTACGCCTTATCTTTTTTTACATACGCCAGACAT  >  W3110S.gb/1953757‑1953821

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑