Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2777253	2777303	51	43 [0]	[0] 24	ypjA	adhesin‑like autotransporter

TTACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCAA  >  W3110S.gb/2777304‑2777366 |                                                               ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCaaa  <  1:4398/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:1829289/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:93005/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:838933/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:83515/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:764658/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:746697/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:704611/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:696510/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:402814/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:299300/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:220888/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:1053319/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:1823252/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:1676653/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:1649124/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:1602779/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:1554951/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:1424626/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:1214250/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:1181256/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:1096329/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:1065266/63‑1 (MQ=255) ttACTTTTAAAACGGTTCAGCGTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCaa  <  1:1255940/63‑1 (MQ=255) |                                                               TTACTTTTAAAACGGTTCAGCTTCACGACACCGTCCAGATAGAAACCACTTTCATGTTCCCAA  >  W3110S.gb/2777304‑2777366

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑