Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2789429	2789903	475	46 [0]	[0] 34	ygaF	hypothetical protein

TAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCG  >  W3110S.gb/2789904‑2789967 |                                                                tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTATCGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:344697/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:515953/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:249033/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:26329/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:27185/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:346823/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:35903/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:362210/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:403238/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:1850456/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:51736/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:812593/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:90879/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:946248/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:958165/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:977060/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:981804/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:1436195/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:1058968/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:1096266/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:1170053/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:1183302/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:1183853/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:1239320/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:1313749/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:1325489/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:1049345/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:1453744/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:1512736/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:1584108/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:1610778/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:1637426/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:1680048/64‑1 (MQ=255) tAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCg  <  1:172168/64‑1 (MQ=255) |                                                                TAACCTTTGAAAACAGGATGTAGCGATGAAACTTAACGACAGTAACTTATTCCGCCAGCAGGCG  >  W3110S.gb/2789904‑2789967

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑