Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3416414 3416515 102 100 [0] [0] 124 acrF multidrug efflux system protein

Only 100 of 124 total aligned reads displayed.

CTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCT  >  W3110S.gb/3416516‑3416579
|                                                               
cTATGCGCTGTTTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1496548/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:356165/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:509852/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:504025/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:487575/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:476761/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:391696/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:387662/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:384418/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:382317/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:372127/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:366027/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:364352/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:554978/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:321525/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:313307/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:312087/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:283818/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:263950/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:261141/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:250967/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:219485/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:213758/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:209082/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:198272/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1876460/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:754478/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:970318/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:889269/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:887740/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:884662/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:867287/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:859905/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:854493/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:852704/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:838357/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:83298/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:820153/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:765652/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1826791/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:728397/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:711059/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:70613/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:629844/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:613447/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:60873/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:601018/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:578001/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:570501/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:56621/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:566133/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1174409/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1456567/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1445781/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1443123/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1439314/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:138442/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1348114/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1335140/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1306010/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1281206/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1235021/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1214890/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1469291/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1162685/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1159483/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1153410/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:111736/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:109876/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1052795/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1051342/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:104212/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1038896/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:103823/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1019560/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1637076/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:180695/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1793144/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1779920/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1778364/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1761265/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1755196/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1744760/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1722087/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1646645/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1643791/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1009926/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1606714/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1587652/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1576026/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1562787/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1548016/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1537506/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1530319/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1522277/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1496036/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1482019/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1481572/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACCTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1655863/64‑1 (MQ=255)
cTATGCGCTGATTGCTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCt  <  1:1171694/64‑1 (MQ=255)
|                                                               
CTATGCGCTGATTGTTGCAGGAATGGTGGTGTTGTTTTTACGTCTTCCGTCTTCCTTCTTACCT  >  W3110S.gb/3416516‑3416579

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑