Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	3517253	3517440	188	27 [0]	[0] 34	[menA]–[rraA]	[menA],[rraA]

TCGTTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCT  >  W3110S.gb/3517441‑3517505 |                                                                 tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:521094/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:344865/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:363711/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:374342/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:374785/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:385378/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:444814/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:472321/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:511374/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:252755/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:565941/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:655346/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:677550/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:788307/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:83396/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:862943/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:883699/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:1549044/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:1045744/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:123164/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:1272939/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:1320462/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:1338591/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:137522/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:1385526/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:1419450/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:1015368/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:1636735/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:1735912/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:1794406/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:1829848/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:1836357/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:1876710/65‑1 (MQ=255) tcgtTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCt  <  1:213389/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TCGTTTGGCGGACAAATAATCACGGTAAAATGTTTCGAGGACAACGGGTTGCTGTACGATCTGCT  >  W3110S.gb/3517441‑3517505

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑