Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3986802	3986851	50	61 [1]	[0] 42	slp/insH	outer membrane lipoprotein/IS5 transposase and trans‑activator

TCGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCG  >  W3110S.gb/3986852‑3986916 |                                                                 tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:466224/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1866076/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1869695/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1873006/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1875040/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:194835/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:247757/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:273913/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:300519/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:31792/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:375500/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1852483/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:470478/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:487238/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:60092/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:692719/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:703396/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:708925/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:829872/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:836561/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:91342/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1520924/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1149861/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1157060/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1208765/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:123828/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1297215/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1299820/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1334239/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1447828/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1456991/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1001415/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1552609/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:157772/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:160261/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1604880/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1636417/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1636619/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1735431/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:1826916/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCg  <  1:183311/65‑1 (MQ=255) tcGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTAACg  <  1:1445117/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TCGTATTGAAATACTTCGAATTGATATTCAGACATTTCTGCCCATGTTTGAATTTTATTGTATCG  >  W3110S.gb/3986852‑3986916

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑