Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1140881	1141133	253	24 [0]	[0] 22	flgK	flagellar hook‑filament junction protein 1

TTTGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAACC  >  W3110S.gb/1141134‑1141198 |                                                                 tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACTCTGAAAcc  <  1:557221/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:1251177/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:770995/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:767700/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:762972/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:655452/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:61270/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:603512/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:543066/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:523268/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:25158/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:249661/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:1815015/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:172829/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:1709000/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:1593095/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:1578909/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:1457327/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:1440998/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:1435860/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAAcc  <  1:1220923/65‑1 (MQ=255) tttGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACACTGAAAcc  <  1:792513/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TTTGATGGTCTGGAGTTGACGTTTACAGGAACGCCTGCCGTTAACGACAGCTTCACGCTGAAACC  >  W3110S.gb/1141134‑1141198

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑