Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2006987 2007226 240 44 [0] [0] 105 fliD flagellar filament capping protein

Only 100 of 105 total aligned reads displayed.

GCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCG  >  W3110S.gb/2007227‑2007291
|                                                                
gCTTCCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1800468/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTATCTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:944643/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:320567/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:523679/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:513734/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:511731/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:477786/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:476496/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:468078/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:429001/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:412080/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:395278/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:38806/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:366458/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:354424/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:529948/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:309065/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:250314/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:21546/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:196873/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:189090/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:188557/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1879566/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1848589/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1830866/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:177910/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:746350/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:96780/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:958485/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:937141/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:936090/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:913138/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:868119/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:85944/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:855128/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:830931/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:825561/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:806875/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:17718/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:741773/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:694206/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:675341/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:665777/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:665725/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:634459/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:631609/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:583961/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:576134/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:575465/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:568793/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:124048/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1420241/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1405013/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1394512/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1381842/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1378285/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1354421/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1328105/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:131074/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:131009/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1271518/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1255383/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1247730/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1427097/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1240011/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1239822/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1231322/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1228937/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1179596/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1158786/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1143153/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:113665/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1115428/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1094680/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:10441/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1587438/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1767377/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1728738/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1718930/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1718188/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:171722/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:171518/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:169916/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1682567/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1677211/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1674031/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1647276/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1593619/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1013126/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1584252/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1581515/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1574823/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1568791/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1549506/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1533426/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1515945/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1503739/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:148997/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1477003/65‑1 (MQ=255)
gCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCg  <  1:1428360/65‑1 (MQ=255)
|                                                                
GCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGCGATCG  >  W3110S.gb/2007227‑2007291

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑