Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4273001	4273101	101	78 [1]	[0] 58	[aphA]	[aphA]

GTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGAAA  >  W3110S.gb/4272933‑4273002                                                                    |   gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:516/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:680664/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:625481/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:61038/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:609482/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:587557/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:583400/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:575117/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:545821/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:533194/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:690638/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:483015/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:470864/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:465301/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:459262/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:457392/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:453883/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:442775/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:420047/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:41691/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:814547/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:997957/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:971555/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:901555/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:87849/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:872761/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:864390/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:859230/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:852910/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:84832/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:413463/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:788687/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:780734/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:746916/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:713248/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:712508/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:709620/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:70241/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:694924/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1259518/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1420279/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1394425/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1383314/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1372511/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1349513/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1341384/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1322765/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1321038/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1313079/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1425598/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1248931/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1242689/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1232133/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1206843/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1108707/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1055432/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1036018/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1030510/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:226869/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:39411/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:393598/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:352098/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:290126/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:288897/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:271495/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:269118/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:239397/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1017179/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1601103/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1592332/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1574395/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1556072/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1517159/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1482589/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1467420/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1442669/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGa    >  1:1430841/1‑68 (MQ=255) gTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTT‑AACATACTGACTATTTAGGGaaa  >  1:1155300/1‑69 (MQ=255)                                                                    |   GTTATGGTCAGATGGTTTTTGCAACAAATCTCACAATAAAAAGTTTCAACATACTGACTATTTAGGGAAA  >  W3110S.gb/4272933‑4273002

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑