Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4273001 4273101 101 78 [1] [0] 58 [aphA] [aphA]

CCTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGAA  >  W3110S.gb/4273102‑4273170
|                                                                    
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACTAATTGaa  <  1:635270/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACATATTGaa  <  1:3078/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:628518/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:331560/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:333473/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:353640/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:378916/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:402763/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:452574/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:454625/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:484251/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:518455/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:587756/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:597237/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:603424/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:62436/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:299509/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:629562/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:709688/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:736495/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:753429/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:753991/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:76057/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:835408/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:862537/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:878414/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:904358/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:916745/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:927982/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1368938/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:102676/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1035723/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:109695/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1171612/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1180751/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:118462/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1242436/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1254781/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1265770/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1282671/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1291824/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1323099/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1329227/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1367297/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1019230/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1396348/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1403657/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1426111/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1441334/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1460834/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1557413/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:155910/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:1567100/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:180626/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:226758/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:255314/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:285584/69‑1 (MQ=255)
ccTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGaa  <  1:289548/69‑1 (MQ=255)
|                                                                    
CCTGGGACTAACGTTGCCAGGCTTGCTGAACAGGCACCCATTCATTGGGTTTCGGTCGCACAAATTGAA  >  W3110S.gb/4273102‑4273170

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: