Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1094185	1094411	227	54 [0]	[0] 76	ycdT	predicted diguanylate cyclase

TGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTATTT  >  W3110S.gb/1094116‑1094184                                                                     | tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:714480/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:1034935/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:325449/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:408085/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:42859/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:440108/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:441745/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:508158/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:522613/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:58972/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:624745/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:62561/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:637936/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:692656/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:324869/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:742694/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:754083/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:780807/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:787324/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:81679/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:841281/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:850217/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:868757/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:890607/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:900111/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:916662/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:981325/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:1366657/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:1039771/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:1045445/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:1073384/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:1110884/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:1124239/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:1131864/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:1184587/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:1187845/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:1202715/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:1211405/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:121940/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:1219973/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:1340518/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:1373667/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:1408541/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:1444760/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:1491016/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:162809/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:209341/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:220098/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:225422/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:256277/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:262622/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:28249/1‑69 (MQ=255) tGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTAAACAGAAATTAttt  >  1:48296/1‑69 (MQ=255) tGCGCCACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTAttt  >  1:322694/1‑69 (MQ=255)                                                                     | TGCGCTACGAGTAACAAAGAACATTGCACATCGCGATCCCTTAACCAATATATTTAACAGAAATTATTT  >  W3110S.gb/1094116‑1094184

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑