Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1137057 1137883 827 189 [0] [0] 57 [flgG]–[flgI] [flgG],flgH,[flgI]

Only 100 of 189 total aligned reads displayed.

AAGAACTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCG  >  W3110S.gb/1136988‑1137056
                                                                    |
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCTCCACCg  <  1:208347/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:590298/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:600072/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:571682/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:552798/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:548385/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:544179/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:503523/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:494937/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:461976/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:458420/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:446732/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:441602/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:428611/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:418140/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:415024/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:399969/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:389000/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:361675/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:334154/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:320675/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:305209/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:245568/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:767539/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:980909/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:945790/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:924541/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:913610/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:892758/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:8708/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:852705/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:842866/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:834473/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:824524/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:81498/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1013457/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:76208/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:726643/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:718053/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:708508/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:690749/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:671228/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:664706/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:652275/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:636734/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:602794/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1183060/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1337154/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:198909/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1314201/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1295058/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1281708/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1277715/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1260557/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1250235/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1234851/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1200147/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1193467/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1321139/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1169901/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1149050/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1140717/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1111337/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1094009/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1074314/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1069929/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1063184/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1041584/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1003237/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1512076/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:197555/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:182922/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:179519/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1591715/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1578806/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1558697/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1547602/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1520162/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:134796/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1492359/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1459877/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1449304/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1437302/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1435527/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1433674/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:140839/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1397706/69‑1 (MQ=255)
aagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1373340/69‑1 (MQ=255)
 agaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1230710/68‑1 (MQ=255)
 agaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:1341842/68‑1 (MQ=255)
 agaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:968812/68‑1 (MQ=255)
 agaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:265411/68‑1 (MQ=255)
 agaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:132843/68‑1 (MQ=255)
 agaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:656142/68‑1 (MQ=255)
 agaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:775724/68‑1 (MQ=255)
   aaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:807597/66‑1 (MQ=255)
     cTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:135712/64‑1 (MQ=255)
                          cAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:900675/43‑1 (MQ=255)
                          cAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCg  <  1:222352/43‑1 (MQ=255)
                               cgcTTACGAAATCAACAGTATAGCGGTGTCCACCAGCg  <  1:350997/38‑1 (MQ=38)
                                                                    |
AAGAACTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCG  >  W3110S.gb/1136988‑1137056

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑