Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2073529 2073612 84 258 [0] [0] 148 yeeP/flu CP4‑44 prophage region; ECK1991:JW5327:b1999; predicted GTP‑binding protein/antigen 43 (Ag43) phase‑variable biofilm formation autotransporter

Only 100 of 258 total aligned reads displayed.

TATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGA  >  W3110S.gb/2073460‑2073528
                                                                    |
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATACCCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1449511/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:536625/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:667934/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:663061/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:654261/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:650217/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:614270/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:602170/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:591085/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:583526/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:582610/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:562545/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:543020/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:686237/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:516582/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:510707/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:476192/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:465907/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:448149/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:444428/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:412266/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:399217/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:377192/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:354605/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:331299/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:314254/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:823717/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:992263/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:976196/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:973162/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:968822/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:94257/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:931184/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:923296/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:915165/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:905333/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:900730/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:86182/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:836745/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:30336/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:790061/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:789171/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:772079/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:761379/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:74688/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:744268/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:732375/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:72026/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:714007/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:704923/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:700470/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1173955/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1319738/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1304986/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1276203/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1258472/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1247112/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:124040/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1233300/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1220257/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1217051/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1209558/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1204242/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1188864/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:134146/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1165124/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1160231/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1153889/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1125202/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1098901/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1082208/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1060382/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1044146/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1031704/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1027607/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1011778/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1529448/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:274048/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:249249/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:230605/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:218944/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:207562/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:192498/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:167443/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1605332/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1579002/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1559220/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1546496/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1001842/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1510936/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1460175/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1438505/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1434546/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1427303/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1420842/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1416804/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1403205/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1393019/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:138050/1‑69 (MQ=255)
tatCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa  >  1:1369310/1‑69 (MQ=255)
                                                                    |
TATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGA  >  W3110S.gb/2073460‑2073528

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: