Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2073529 2073612 84 258 [0] [0] 148 yeeP/flu CP4‑44 prophage region; ECK1991:JW5327:b1999; predicted GTP‑binding protein/antigen 43 (Ag43) phase‑variable biofilm formation autotransporter

Only 100 of 148 total aligned reads displayed.

CTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGAA  >  W3110S.gb/2073613‑2073680
|                                                                   
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTgaagaa  <  1:619423/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:567355/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:707326/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:681567/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:657548/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:651840/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:648455/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:648092/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:633518/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:61369/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:612785/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:599781/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:579750/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:715324/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:559194/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:481720/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:461546/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:461131/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:431042/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:430607/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:409879/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:407115/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:368628/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:33541/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1011867/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:844265/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:982368/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:977763/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:965765/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:94936/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:94130/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:93611/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:92580/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:917353/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:870364/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:850290/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:844784/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:31188/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:824685/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:821044/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:80739/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:791969/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:791779/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:784031/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:763765/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:749783/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:749145/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:737618/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:730694/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1157371/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1435063/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1417561/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1364602/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1348527/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1323856/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1318864/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1313743/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1310708/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1266743/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1249270/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1236549/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1221833/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1469059/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1157303/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1144734/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1137687/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:111880/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1114409/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1102161/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1091498/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1068704/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:105828/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1047915/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1027593/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1476180/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:291324/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:256795/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:244465/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:23270/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:228696/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:220354/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:217324/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:209809/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:203897/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:185722/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:180453/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:163813/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1599042/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1593845/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1581035/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1548656/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1544106/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1537908/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1528680/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:151462/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1502008/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:1500022/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:291480/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCAACCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:572756/68‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTAATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGaa  <  1:815340/68‑1 (MQ=255)
|                                                                   
CTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTACCGGCTTTTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGAA  >  W3110S.gb/2073613‑2073680

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑