Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3986969	3987022	54	63 [0]	[0] 107	slp/insH	outer membrane lipoprotein/IS5 transposase and trans‑activator

TGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCT  >  W3110S.gb/3986900‑3986968                                                                     | tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:648739/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:391608/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:403838/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:412247/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:418453/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:431633/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:4657/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:479911/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:493631/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:542062/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:547846/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:548865/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:551150/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:570944/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:606204/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:635331/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:391540/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:657492/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:702405/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:73272/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:743253/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:782148/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:806641/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:817716/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:81898/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:83962/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:840490/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:869093/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:880762/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:896521/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:954642/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:957433/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1443075/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1010931/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1029473/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1139057/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1183849/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1184767/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1205359/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1209589/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1218663/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1266143/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1307643/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1325286/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1336598/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:134811/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1371613/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1372197/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1001054/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1468917/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1469412/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1482032/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1545496/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1546450/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:155423/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1554472/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:1604167/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:179162/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:192162/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:237156/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:294557/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:3215/1‑69 (MQ=255) tGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCt  >  1:365951/1‑69 (MQ=255)                                                                     | TGAATTTTATTGTATCGGGAGAGTGTCGTAAAGGCTTTAACTTGCTTATAACATTGTCTTTGGAATTCT  >  W3110S.gb/3986900‑3986968

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑