Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3986969 3987022 54 63 [0] [0] 107 slp/insH outer membrane lipoprotein/IS5 transposase and trans‑activator

Only 100 of 107 total aligned reads displayed.

AATTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATG  >  W3110S.gb/3987023‑3987089
|                                                                  
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAGGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1296844/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAGGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1294675/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:530224/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:630884/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:618512/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:597513/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:576998/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:574816/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:566589/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:550173/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:546262/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:538590/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:536774/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:536143/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:701568/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:527178/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:513307/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:504710/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:490848/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:487948/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:479505/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:458547/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:430791/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:385644/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:384285/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:369982/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:322274/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:854806/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:963956/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:959822/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:954203/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:948935/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:941521/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:907936/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:905572/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:887045/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:872508/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:865712/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:865265/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:690008/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:848704/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:833752/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:793178/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:787123/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:785789/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:780596/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:768823/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:768068/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:757221/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:715255/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:27371/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1261098/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1387994/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1384776/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1359690/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1333698/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1331814/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1330999/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1329605/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1325897/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1281968/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:127698/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1268800/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1392315/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1252309/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1246169/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1220032/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1156494/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1148092/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1138914/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1079555/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1069274/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1066998/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1052693/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1043100/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1521607/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1039185/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:265945/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:263182/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:254699/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:235790/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:213462/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:212539/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:175604/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1547403/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1537959/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1535275/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:300534/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1514633/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1505438/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:149858/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:14896/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1485187/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1479836/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1472005/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1466827/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1460383/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1454971/67‑1 (MQ=255)
aaTTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:1396149/67‑1 (MQ=255)
aaTATAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATg  <  1:125713/67‑1 (MQ=255)
|                                                                  
AATTTAATTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATG  >  W3110S.gb/3987023‑3987089

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: