Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4080638 4081236 599 162 [0] [0] 36 rtcR sigma 54‑dependent transcriptional regulator of rtcBA expression

Only 100 of 162 total aligned reads displayed.

GATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGA  >  W3110S.gb/4080569‑4080637
                                                                    |
gagccTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAACCGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:169220/66‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAACCGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1261741/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAACCGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1381589/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:212463/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:454739/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:374080/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:372217/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:343490/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:339816/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:286897/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:258931/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:252453/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:479644/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:19989/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:165706/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1568526/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:155665/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1514514/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1512424/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:817888/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:988603/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:961635/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:934297/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:900473/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:875826/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:857168/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:847558/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:822370/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1022435/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:760386/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:754982/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:735233/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:660668/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:615431/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:606473/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:506569/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:493151/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1140729/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1029909/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1053056/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1194585/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1193129/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1174259/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1069876/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1165356/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1144382/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1204877/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:113423/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1125939/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1121816/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1120065/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1109057/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1106949/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1076546/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:107601/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:138711/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1366967/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:139695/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1346534/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1423002/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1325726/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1405590/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGTCACACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1350501/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGGCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:351094/69‑1 (MQ=255)
gATCCTGCACGGCTTCCCACGCCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGGCATTGa  <  1:165774/69‑1 (MQ=255)
 aTCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1318042/68‑1 (MQ=255)
 aTCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1595208/68‑1 (MQ=255)
 aTCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:877261/68‑1 (MQ=255)
 aTCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:53569/68‑1 (MQ=255)
 aTCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:490882/68‑1 (MQ=255)
 aTCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:365975/68‑1 (MQ=255)
 aTCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:385533/68‑1 (MQ=255)
 aTCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:412671/68‑1 (MQ=255)
 aTCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGAGCCGCGTCATTGa  <  1:774787/68‑1 (MQ=255)
 aTCCTGCACGGCTTCCCACGGCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:588109/68‑1 (MQ=255)
 aTCCTGCACGGCTTCCCACGGCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:447561/68‑1 (MQ=255)
 aTCCTGCACGGCTTCCAACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1336193/68‑1 (MQ=255)
 aTCCGGCACGGCTTCCCCCGTCAGACCAAACCGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:785592/68‑1 (MQ=255)
  tCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:68535/67‑1 (MQ=255)
   ccTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:579863/66‑1 (MQ=255)
   ccTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:3529/66‑1 (MQ=255)
    cTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAACCGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:409297/65‑1 (MQ=255)
      gCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:863849/63‑1 (MQ=255)
               cccACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:300723/54‑1 (MQ=255)
                   cGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:557681/50‑1 (MQ=255)
                     tCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1263547/48‑1 (MQ=255)
                      cAGACCAAACCGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:559473/47‑1 (MQ=255)
                         aCCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:199620/44‑1 (MQ=255)
                         aCCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1249024/44‑1 (MQ=255)
                          ccAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:800199/43‑1 (MQ=255)
                          ccAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:554034/43‑1 (MQ=255)
                          caaaaaCGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:251662/41‑1 (MQ=255)
                           cAAAACGCGCCAGTTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1531074/42‑1 (MQ=255)
                           cAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1467779/42‑1 (MQ=255)
                             aaaCGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1011493/40‑1 (MQ=255)
                             aaaCGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:609777/40‑1 (MQ=255)
                             aaaCGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:1280739/40‑1 (MQ=255)
                               aCGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:14465/38‑1 (MQ=255)
                                 gcgcCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:518677/36‑1 (MQ=255)
                                  cgcCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGa  <  1:128305/35‑1 (MQ=255)
                                                                    |
GATCCTGCACGGCTTCCCACGTCAGACCAAAACGCGCCAGGTATTTGCGTAGCCGATCCGCGTCATTGA  >  W3110S.gb/4080569‑4080637

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: