Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4114156	4114488	333	50 [0]	[0] 86	[nudE]	[nudE]

AAACCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAATTTGAT  >  W3110S.gb/4114088‑4114155                                                                    | aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGTAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:1321549/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:71248/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:386286/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:416809/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:448773/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:503130/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:539922/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:552560/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:613941/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:629686/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:657807/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:670915/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:699960/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:708267/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:112767/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:718182/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:729561/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:753795/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:761234/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:870255/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:877289/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:904608/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:935313/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:937908/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:974218/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:997884/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:142212/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:1102987/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:113779/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:1176770/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:1231015/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:1267135/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:1318676/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:132770/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:1366504/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:1385140/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:1391124/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:1421572/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:1444056/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:1581967/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:1602601/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:175255/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:182597/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:210774/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:21842/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:236344/68‑1 (MQ=255) aaaCCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:287464/68‑1 (MQ=255)    cccTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:1439117/65‑1 (MQ=255)                  aaTATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:370413/51‑1 (MQ=255)                             aTTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAatttgat  <  1:1550003/40‑1 (MQ=255)                                                                    | AAACCCTCTGAAGGCGGAATATCAGCAAATTCCTGGAGTTATTTCAACCTATTGACTTTTAATTTGAT  >  W3110S.gb/4114088‑4114155

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑