Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4114156	4114488	333	50 [0]	[0] 86	[nudE]	[nudE]

AATTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCT  >  W3110S.gb/4114489‑4114555 |                                                                   aaTTAGGTTTTTCGTAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1186902/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:456450/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:575272/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:563643/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:549477/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:526317/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:522111/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:521623/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:518256/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:468885/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:461647/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:610201/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:423249/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:41086/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:404944/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:399637/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:370343/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:363704/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:356266/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:323421/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:319398/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:301786/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:774789/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:988651/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:962609/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:945970/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:93986/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:87862/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:865658/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:862657/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:836373/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:833780/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:797243/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:580057/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:766588/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:733291/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:690035/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:666779/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:648478/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:639352/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:62556/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:613171/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:300212/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1170233/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1013911/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1296276/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1291795/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1290404/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1270131/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:123414/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1231888/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1226822/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1221978/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1313738/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1165216/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1163252/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1137229/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1121667/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1071443/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1064626/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1062772/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:105077/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:101400/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1501156/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:293759/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:280516/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:268113/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:206685/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1540638/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1531143/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1317630/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1439520/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1427992/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1387930/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1375355/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:137103/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1362120/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1331360/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1323834/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1323640/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGGGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:630065/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGGGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1147653/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGGGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:220440/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGGGAAAGCGGCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:169882/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGGTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:1147090/67‑1 (MQ=255) aaTTAGGGTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCt  <  1:251498/67‑1 (MQ=255) |                                                                   AATTAGGTTTTTCGAAAGGATTAATTGATCCGGGTGAAAGCGTCTACGAAGCCGCTAACCGCGAGCT  >  W3110S.gb/4114489‑4114555

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑