Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	296095	296317	223	108 [0]	[0] 13	intF	predicted phage integrase

CATCAACTTTTGTTAATTTCAATCAACGGGTTTATTGCTATAACTTGGTGTTTTATAATATAAAGTATG  >  W3110S.gb/296318‑296386 |                                                                     cATCAACTTTTGTTAATTTCAATCAACGGGTTTATTGCTATAACTTGGTGTTTtataa             >  1:1287076/1‑58 (MQ=255) cATCAACTTTTGTTAATTTCAATCAACGGGTTTATTGCTATAACTTGGTGTTTTATAATATAAAGTAtg  >  1:1271010/1‑69 (MQ=255) cATCAACTTTTGTTAATTTCAATCAACGGGTTTATTGCTATAACTTGGTGTTTTATAATATAAAGTAtg  >  1:1364523/1‑69 (MQ=255) cATCAACTTTTGTTAATTTCAATCAACGGGTTTATTGCTATAACTTGGTGTTTTATAATATAAAGTAtg  >  1:311183/1‑69 (MQ=255) cATCAACTTTTGTTAATTTCAATCAACGGGTTTATTGCTATAACTTGGTGTTTTATAATATAAAGTAtg  >  1:472423/1‑69 (MQ=255) cATCAACTTTTGTTAATTTCAATCAACGGGTTTATTGCTATAACTTGGTGTTTTATAATATAAAGTAtg  >  1:573576/1‑69 (MQ=255) cATCAACTTTTGTTAATTTCAATCAACGGGTTTATTGCTATAACTTGGTGTTTTATAATATAAAGTAtg  >  1:600948/1‑69 (MQ=255) cATCAACTTTTGTTAATTTCAATCAACGGGTTTATTGCTATAACTTGGTGTTTTATAATATAAAGTAtg  >  1:607311/1‑69 (MQ=255) cATCAACTTTTGTTAATTTCAATCAACGGGTTTATTGCTATAACTTGGTGTTTTATAATATAAAGTAtg  >  1:833724/1‑69 (MQ=255) cATCAACTTTTGTTAATTTCAATCAACGGGTTTATTGCTATAACTTGGTGTTTTATAATATAAAGTAtg  >  1:85921/1‑69 (MQ=255) cATCAACTTTTGTTAATTTCAATCAACGGGTTTATTGCTATAACTTGGTGTTTTATAATATAAAGTAtg  >  1:933527/1‑69 (MQ=255) cATCAACTTTTGTTAATTTCAATCAACGGGTTTATTGCTATAACTTGGTGTTTTATAATATAAAGTAt   >  1:1046635/1‑68 (MQ=255) cATCAACTTTTGTTAATTTCAATCAACGGGTTTATTGCTATAACTTGGTGTTTTATAATATAAAGTAt   >  1:267573/1‑68 (MQ=255) |                                                                     CATCAACTTTTGTTAATTTCAATCAACGGGTTTATTGCTATAACTTGGTGTTTTATAATATAAAGTATG  >  W3110S.gb/296318‑296386

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑