Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3669986	3670120	135	55 [0]	[0] 68	rho	transcription termination factor

ATCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCATACGAGCCA  >  W3110S.gb/3670121‑3670188 |                                                                    atCTTCTCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:206155/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGt                       >  1:228477/1‑47 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCa           >  1:296128/1‑59 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:711529/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:753198/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:695129/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:685615/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:645374/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:637530/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:600909/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:585157/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:584117/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:581458/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:556305/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:546459/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:543914/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:493528/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:469210/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:839452/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:994250/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:962342/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:900764/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:895796/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:880288/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:876873/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:87469/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:843165/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:458525/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:838016/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:82308/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:783800/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:781450/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:778637/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:758269/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:75672/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1218093/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1390730/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1378362/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:136416/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1300549/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1274483/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1266630/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1238841/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1237029/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1400834/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1206874/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1176870/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1167093/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1093897/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1075016/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1063912/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1056322/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:460744/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1408986/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1419292/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1464886/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1494543/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1534351/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:16935/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:217621/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:263832/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:314709/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:330889/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:337966/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:391197/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:40377/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCAt          >  1:1049763/1‑60 (MQ=255) atCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCATACGAgata  >  1:583339/1‑65 (MQ=255) |                                                                    ATCTTCGCCACTCTTTGCGTGCTGCTTCAGGATGGCAAAAATAATGTCCTGCTTACGCATACGAGCCA  >  W3110S.gb/3670121‑3670188

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑