| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 606711 | 47 (1.020) | 5 (0.130) +CCCGGGTTG |
3/78 | NT | 11.6% | intergenic (‑105/‑348) | ybdK/hokE | gamma‑glutamyl:cysteine ligase/toxic polypeptide, small |
| ? | W3110S.gb | 3793220 = | 47 (1.020) | intergenic (+108/‑30) | uhpC/uhpT | membrane protein regulates uhpT expression/hexose phosphate transporter | |||||
TAGAAGTCGGAGCGGCTGGGCGAGATGCGGAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTGCTGACTGGTGGCGAAGAA > W3110S.gb/606641‑606781 | taGAAGTCGGAGCGGCTGGGCGAGATGCGGAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGa > 1:1131418/1‑71 (MQ=255)taGAAGTCGGAGCGGCTGGGCGAGATGCGGAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGa > 1:1165652/1‑71 (MQ=255)taGAAGTCGGAGCGGCTGGGCGAGATGCGGAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGa > 1:1339125/1‑71 (MQ=255) aGTCGGAGCGGCTGGGCGAGATGCGGAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGt < 1:2991794/71‑1 (MQ=255) cGGAGCGGCTGGGCGAGATGCGGAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGcc > 1:3935626/1‑71 (MQ=255) cGGCTGGGCGAGATGCGGAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAg < 1:4432578/71‑1 (MQ=255) gCTGGGCGAGATGCGGAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGc > 1:195316/1‑70 (MQ=255) cTGGGCGAGATGCGGAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCaa < 1:3450634/71‑1 (MQ=255) cGAGATGCGGAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAAtt > 1:2641752/1‑68 (MQ=255) agagGCGGAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCt < 1:1962121/71‑1 (MQ=255) agaTGCGGAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGc < 1:1830659/62‑1 (MQ=255) gCGGAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGa > 1:2724351/1‑45 (MQ=255) cGGAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGAt < 1:1118005/45‑1 (MQ=255) cGGAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACttt < 1:780559/71‑1 (MQ=255) cGGAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACttt < 1:3558899/71‑1 (MQ=255) gAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATgg > 1:3359630/1‑45 (MQ=255) gAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACtttt > 1:85416/1‑70 (MQ=255) aaGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGc < 1:2714285/71‑1 (MQ=255) ttCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACtt < 1:656636/64‑1 (MQ=255) ttCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCa < 1:3450170/69‑1 (MQ=255) tCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGa > 1:1619783/1‑37 (MQ=255) gAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAAttt > 1:1657655/1‑51 (MQ=255) gAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAAtt > 1:4250904/1‑50 (MQ=255) gAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGc > 1:2774281/1‑63 (MQ=255) gAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCa > 1:2655956/1‑64 (MQ=255) aaTGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACa < 1:3973876/71‑1 (MQ=255) gTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGc < 1:186779/59‑1 (MQ=255) tttCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGtt < 1:2612954/71‑1 (MQ=255) cTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCaa < 1:661689/40‑1 (MQ=255) cTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAAt > 1:2031124/1‑41 (MQ=255) ttttttGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATgg < 1:2890300/69‑1 (MQ=255) ttttttGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGc < 1:4518893/70‑1 (MQ=255) ttGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTg < 1:3975863/70‑1 (MQ=255) tggtgatggtgaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTGCt > 1:177732/1‑71 (MQ=255) ggtgatggtgaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTGCt < 1:3169537/70‑1 (MQ=255) ggtgatggtgaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTGCt < 1:2924376/70‑1 (MQ=255) ttgatggtgaaCTGAcccgggttgtcacgcaggtattc < 1:662901‑M1/37‑24 (MQ=255) gtgatggtgaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTGCTg < 1:560642/70‑1 (MQ=255) tgatggtgaACTGAcccgggttgtcacgcaggtatt > 1:317272‑M1/1‑14 (MQ=255) tgatggtgaACTGAcccgggttgtcacgcaggtat > 1:2335091‑M1/1‑14 (MQ=255) tgatggtgaACTGAcccgggttgtcacgcaggtat < 1:2000975‑M1/35‑22 (MQ=255) tgatggtgaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGc < 1:123239/44‑1 (MQ=255) tgatggtgaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGc < 1:1195365/44‑1 (MQ=255) gatggtgaACTGAcccgggttgtcacgcaggtatt > 1:556457‑M1/1‑13 (MQ=255) atggtgaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGt < 1:3307198/54‑1 (MQ=255) atggtgaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTa < 1:2015663/56‑1 (MQ=255) atggtgaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTGCTGACt < 1:3335854/70‑1 (MQ=255) tggtgaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGt < 1:2387708/53‑1 (MQ=255) tggtgaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTGCTGACt < 1:2898063/69‑1 (MQ=255) ggtgaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATg > 1:1193961/1‑56 (MQ=255) gtgaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACtttt > 1:952072/1‑37 (MQ=255) gtgaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACtt > 1:3411270/1‑35 (MQ=255) gtgaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACtt > 1:1541045/1‑35 (MQ=255) gtgaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTa > 1:1019961/1‑53 (MQ=255) gtgaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTGCTGACtggtg > 1:650966/1‑71 (MQ=255) tgaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCTATGTGACAAGTTATgg < 1:1901110/55‑1 (MQ=255) gaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCaa > 1:1942864/1‑39 (MQ=255) gaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTa > 1:1426026/1‑51 (MQ=255) gaACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTGCTGACtggtgg > 1:3494073/1‑70 (MQ=255) aaCTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCa > 1:2741434/1‑55 (MQ=255) aCTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTGCTGACtggt > 1:3393378/1‑66 (MQ=255) aCTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTGCTGACtg > 1:2450084/1‑64 (MQ=255) cTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCaa > 1:2345278/1‑36 (MQ=255) cTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGt < 1:626096/46‑1 (MQ=255) cTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCa > 1:4331536/1‑53 (MQ=255) tGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAAt > 1:3988246/1‑36 (MQ=255) tGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGt < 1:1579228/45‑1 (MQ=255) gATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTGCTGACt < 1:351613/60‑1 (MQ=255) gATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTGCTGACTGGTGGCgaag > 1:3799968/1‑70 (MQ=255) gATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTGCTGACTGGTGGCgaag > 1:3702990/1‑70 (MQ=255) aTGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGa > 1:2503641/1‑38 (MQ=255) aTGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTGCTGACtgg > 1:1885204/1‑61 (MQ=255) aTGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTGCTGACTGGTGGCgaagaa < 1:3547555/71‑1 (MQ=255) aTGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTGCTGACTGGTGGCgaag < 1:1533482/69‑1 (MQ=255) | TAGAAGTCGGAGCGGCTGGGCGAGATGCGGAAGTTCTGGAATGTTTCTTTTTTTTGGTGATGGTGAACTGATGGTGCCTGAAGCAATTTGGCTACTTTTGCAATGTGACAAGTTATGGCAGTGCTGACTGGTGGCGAAGAA > W3110S.gb/606641‑606781 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |