| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 315707 | NA (NA) | 48 (1.040) | 31/96 | NT | 100% | coding (654/687 nt) | ykgA | predicted DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | W3110S.gb | 576911 = | 0 (0.000) | coding (76/498 nt) | ybcS | predicted lysozyme | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
CCATCATTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTATG > W3110S.gb/576842‑576981 | ctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaAc > 1:829996‑M2/70‑71 (MQ=255)ctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaAc > 1:2574770‑M2/70‑71 (MQ=255) catcatTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACt > 1:776409/1‑71 (MQ=255) cagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTg > 1:3001886‑M2/68‑71 (MQ=255) tcatTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtg > 1:1439811‑M2/1‑69 (MQ=255) agtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACt > 1:3338562‑M2/67‑69 (MQ=255) agtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTg < 1:116698‑M2/4‑1 (MQ=255) atTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgat < 1:4258505‑M2/71‑5 (MQ=255) atTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgat < 1:3161500‑M2/71‑5 (MQ=255) atTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtga > 1:4102029‑M2/1‑67 (MQ=255) gaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGccc < 1:1835495‑M2/8‑1 (MQ=255) gaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAg > 1:405639‑M2/61‑71 (MQ=255) cGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatctt > 1:1987649‑M2/1‑63 (MQ=255) cGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgagctt > 1:1469083‑M2/1‑63 (MQ=255) gAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatct > 1:1921789‑M2/1‑62 (MQ=255) aaaGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtg > 1:93123‑M2/1‑60 (MQ=255) tttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaa > 1:890244‑M2/55‑55 (MQ=255) ccGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgat > 1:4221936‑M2/1‑56 (MQ=255) gTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaat > 1:2493485‑M2/1‑54 (MQ=255) ttGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaat > 1:4272979‑M2/1‑53 (MQ=255) ctcctgctATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaa < 1:3365421‑M2/66‑17 (MQ=255) aagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCt > 1:1244709‑M2/46‑71 (MQ=255) agaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTg > 1:1569523‑M2/45‑71 (MQ=255) gaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaAc > 1:3052987‑M2/44‑45 (MQ=255) acctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGaa < 1:2351560‑M2/30‑1 (MQ=255) ttGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcgg < 1:497353‑M2/71‑31 (MQ=255) ttGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaa > 1:1138953‑M2/1‑41 (MQ=255) ttGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaa > 1:3167839‑M2/1‑41 (MQ=255) ttGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtga > 1:3678428‑M2/1‑41 (MQ=255) tcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaAc > 1:2401709‑M2/39‑40 (MQ=255) cgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGgtg > 1:2030288‑M2/38‑71 (MQ=255) ggtggCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatc < 1:3740607‑M2/44‑6 (MQ=255) gtggCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagc > 1:4639845‑M2/1‑38 (MQ=255) gCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggct > 1:1184332‑M2/1‑35 (MQ=255) gCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatag > 1:3527975‑M2/1‑35 (MQ=255) cGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtg > 1:2945182‑M2/1‑34 (MQ=255) ggAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtga > 1:3300263‑M2/1‑33 (MQ=255) gcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTa < 1:468117‑M2/41‑1 (MQ=255) gAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagt < 1:817646‑M2/52‑21 (MQ=255) tgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCa < 1:4114504‑M2/9‑1 (MQ=255) gCAATTGCTATATCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtg > 1:3869902‑M2/1‑30 (MQ=255) gCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaa > 1:4432277‑M2/1‑30 (MQ=255) gCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaa > 1:3982070‑M2/1‑30 (MQ=255) gtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGaa < 1:3791126‑M2/30‑1 (MQ=255) cAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatctta > 1:742618‑M2/1‑29 (MQ=255) tgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATg < 1:2889763‑M2/22‑1 (MQ=255) aTTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaac < 1:1467422‑M2/71‑45 (MQ=255) aTTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaag > 1:15218‑M2/1‑27 (MQ=255) tccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACg < 1:2201665‑M2/19‑1 (MQ=255) gCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactct < 1:4496353‑M2/71‑48 (MQ=255) gCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggaca < 1:1961400‑M2/49‑26 (MQ=255) gCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtgga > 1:2069032‑M2/1‑24 (MQ=255) gCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaata < 1:765875‑M2/42‑19 (MQ=255) gCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaata < 1:712342‑M2/42‑19 (MQ=255) catattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAcataccata > 1:3608945‑M2/22‑71 (MQ=255) atattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGa < 1:3234336‑M2/20‑1 (MQ=255) tattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAAc < 1:304440‑M2/18‑1 (MQ=255) tattacgtaggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGa < 1:2923017‑M2/20‑1 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATg > 1:1733529‑M2/18‑39 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGt > 1:1055877‑M2/18‑41 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGt > 1:663304‑M2/18‑41 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAg > 1:731947‑M2/18‑55 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAg > 1:1296524‑M2/18‑55 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACa > 1:572775‑M2/18‑69 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACa > 1:4151464‑M2/18‑69 (MQ=255) tacgtgggtaggatcaACTGGCCGAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAca > 1:3602439‑M2/17‑59 (MQ=255) tacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACaaa < 1:4501193‑M2/54‑1 (MQ=255) gCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtca > 1:3433813‑M2/1‑18 (MQ=255) gCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgag < 1:2797791‑M2/57‑40 (MQ=255) acgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAg > 1:4272993‑M2/16‑53 (MQ=255) cgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGa < 1:3128366‑M2/56‑1 (MQ=255) cATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcag > 1:3887441‑M2/1‑17 (MQ=255) cATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtg < 1:3415252‑M2/54‑38 (MQ=255) tCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagta > 1:907248‑M2/1‑15 (MQ=255) cAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagag < 1:1016577‑M2/70‑57 (MQ=255) ggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATAtt < 1:598553‑M2/60‑1 (MQ=255) aGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggt < 1:2197924‑M2/71‑59 (MQ=255) aGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggt < 1:3806159‑M2/71‑59 (MQ=255) aGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggt > 1:1233380‑M2/1‑13 (MQ=255) aGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggt > 1:4223780‑M2/1‑13 (MQ=255) aGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagagg < 1:4489850‑M2/70‑58 (MQ=255) gtgtTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggcta > 1:4498278‑M2/1‑12 (MQ=255) gtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCt < 1:1779603‑M2/40‑1 (MQ=255) gtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGCTCTCGAAGgt > 1:2420729‑M2/10‑42 (MQ=255) taggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATAttgtt > 1:1744092‑M2/9‑71 (MQ=255) taggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATAttgtt < 1:1240717‑M2/63‑1 (MQ=255) aggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTGCATACCATACAAAGatat > 1:4013424‑M2/8‑66 (MQ=255) ggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATAttg > 1:248131‑M2/7‑67 (MQ=255) ggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTgg < 1:3496781‑M2/65‑1 (MQ=255) ggatcaACTGGCCCAAGTGCTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTgg > 1:707169‑M2/7‑71 (MQ=255) gatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGata < 1:4069603‑M2/58‑1 (MQ=255) atcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTa < 1:2560957‑M2/41‑1 (MQ=255) atcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGgtg < 1:3557113‑M2/67‑1 (MQ=255) atcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCGGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGgtg > 1:683403‑M2/5‑71 (MQ=255) tcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACaaa > 1:1108376‑M2/4‑57 (MQ=255) tcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATAtt > 1:1856744‑M2/4‑63 (MQ=255) caACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGatat > 1:2380642‑M2/3‑61 (MQ=255) aACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTa < 1:3652418‑M2/69‑1 (MQ=255) aCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtca > 1:143151‑M2/1‑3 (MQ=255) aCTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCt < 1:2049536/40‑1 (MQ=255) | CCATCATTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTATG > W3110S.gb/576842‑576981 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |