| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 315707 | NA (NA) | 46 (1.190) | 20/102 | NT | 100% | coding (654/687 nt) | ykgA | predicted DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | W3110S.gb | 576911 = | 0 (0.000) | coding (76/498 nt) | ybcS | predicted lysozyme | |||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
CCATCATTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTAT > W3110S.gb/576842‑576980 | ctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaAc < 1:847016‑M2/2‑1 (MQ=255) catcatTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACt > 1:1010457/1‑71 (MQ=255) tcatTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTt < 1:2654993‑M2/70‑2 (MQ=255) catTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGAGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtga < 1:3335876‑M2/71‑4 (MQ=255) atTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgat < 1:3197414‑M2/71‑5 (MQ=255) atTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtga > 1:1802907‑M2/1‑67 (MQ=255) atTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtga < 1:561483‑M2/70‑4 (MQ=255) atTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtga < 1:2106255‑M2/70‑4 (MQ=255) atTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtga < 1:2409507‑M2/70‑4 (MQ=255) atTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtga < 1:2445903‑M2/70‑4 (MQ=255) atTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtga > 1:1651232‑M2/1‑67 (MQ=255) ttACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtga > 1:1079254‑M2/1‑66 (MQ=255) cggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaAc > 1:2885901‑M2/63‑64 (MQ=255) cggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGccc > 1:156956‑M2/63‑70 (MQ=255) aCGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTttatct < 1:2230435‑M2/70‑7 (MQ=255) aCGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatct < 1:2719905‑M2/70‑7 (MQ=255) cGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatctt > 1:2646923‑M2/1‑63 (MQ=255) cGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatctt > 1:3414183‑M2/1‑63 (MQ=255) cGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatctt > 1:1698058‑M2/1‑63 (MQ=255) aaGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacc < 1:177496‑M2/69‑11 (MQ=255) aaGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacc < 1:504974‑M2/69‑11 (MQ=255) atttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGt > 1:1749226‑M2/56‑70 (MQ=255) gCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagc > 1:482788‑M2/1‑57 (MQ=255) gCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGAATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagc > 1:3560538‑M2/1‑57 (MQ=255) ccGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCATTTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacc > 1:2987237‑M2/1‑56 (MQ=255) tgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAAc < 1:1972167‑M2/18‑1 (MQ=255) tgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAAc < 1:975047‑M2/18‑1 (MQ=255) cGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaa > 1:26352‑M2/1‑55 (MQ=255) cGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaa > 1:301809‑M2/1‑55 (MQ=255) cGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaa > 1:30393‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaata > 1:3684323‑M2/1‑53 (MQ=255) ttGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaata > 1:3702620‑M2/1‑53 (MQ=255) ttGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaata > 1:3349461‑M2/1‑53 (MQ=255) ttGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaata > 1:455049‑M2/1‑53 (MQ=255) aacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATgg < 1:2218662‑M2/23‑1 (MQ=255) ctgctgctATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtg > 1:2435405‑M2/1‑50 (MQ=255) acaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGt < 1:66613‑M2/24‑1 (MQ=255) gctgctATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtgga < 1:3222444‑M2/71‑24 (MQ=255) gctgctATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtgga < 1:2044238‑M2/71‑24 (MQ=255) gctgccATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtgga < 1:3490613‑M2/71‑24 (MQ=255) ctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACg > 1:2041737‑M2/40‑58 (MQ=255) ctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAgg > 1:1626277‑M2/40‑71 (MQ=255) aTTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCAc > 1:3264565/1‑41 (MQ=255) ggtggCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggc < 1:914595‑M2/70‑32 (MQ=255) ggtggCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggc < 1:1531558‑M2/70‑32 (MQ=255) ggtggCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaata < 1:1533992‑M2/57‑19 (MQ=255) ggtggCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaata < 1:1856973‑M2/57‑19 (MQ=255) cGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtg > 1:2445938‑M2/1‑34 (MQ=255) tgtccatattacgtgggtaggatcaATTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAcata < 1:231402‑M2/45‑1 (MQ=255) tgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAcata < 1:934766‑M2/45‑1 (MQ=255) tgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAcata < 1:1657238‑M2/45‑1 (MQ=255) ttGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtg > 1:1750168‑M2/1‑26 (MQ=255) tccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAcatacca > 1:2970871‑M2/24‑71 (MQ=255) tccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAcatacc > 1:1859747‑M2/24‑70 (MQ=255) gCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactct < 1:1398604‑M2/71‑48 (MQ=255) gCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactct < 1:1867119‑M2/71‑48 (MQ=255) gCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtgga < 1:616770‑M2/47‑24 (MQ=255) gCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatag < 1:441868‑M2/43‑20 (MQ=255) gCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatag < 1:1966573‑M2/43‑20 (MQ=255) gCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatag < 1:2923203‑M2/43‑20 (MQ=255) tattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTa < 1:109935‑M2/41‑1 (MQ=255) tattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTa < 1:1424125‑M2/41‑1 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAca > 1:1177808‑M2/18‑60 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACa > 1:681000‑M2/18‑69 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACa > 1:1990377‑M2/18‑69 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACa > 1:2987025‑M2/18‑69 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACa > 1:1253492‑M2/18‑69 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACa > 1:1560988‑M2/18‑69 (MQ=255) tacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCa > 1:68984‑M2/17‑53 (MQ=255) tacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCa > 1:167174‑M2/17‑53 (MQ=255) tacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCa > 1:1265280‑M2/17‑53 (MQ=255) tacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCa > 1:2943231‑M2/17‑53 (MQ=255) gCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagt < 1:1777299‑M2/69‑52 (MQ=255) acgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAg < 1:1939486‑M2/55‑1 (MQ=255) cATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcag > 1:2857263‑M2/1‑17 (MQ=255) tgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGatat < 1:3252052‑M2/59‑1 (MQ=255) tgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGatat < 1:1891306‑M2/59‑1 (MQ=255) aGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggt > 1:2675170‑M2/1‑13 (MQ=255) aGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggt > 1:415562‑M2/1‑13 (MQ=255) aGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggt < 1:83845‑M2/71‑59 (MQ=255) aggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAca > 1:2099011‑M2/8‑50 (MQ=255) ggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTgg > 1:1795596‑M2/7‑71 (MQ=255) gatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGaa < 1:3137105‑M2/30‑1 (MQ=255) gatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGaa < 1:1464862‑M2/30‑1 (MQ=255) atcaACTGTCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGgtg < 1:2855768‑M2/67‑1 (MQ=255) atcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGgtg < 1:1624516‑M2/67‑1 (MQ=255) aTCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactca > 1:2700769‑M2/1‑6 (MQ=255) aTCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactca > 1:505125‑M2/1‑6 (MQ=255) aTCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactca > 1:815521‑M2/1‑6 (MQ=255) aTCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactca > 1:808516‑M2/1‑6 (MQ=255) aTCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactca > 1:3223057‑M2/1‑6 (MQ=255) tCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcaga > 1:233081‑M2/1‑5 (MQ=255) tCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcaga > 1:1451567‑M2/1‑5 (MQ=255) tCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggcta > 1:915364‑M2/1‑5 (MQ=255) aCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtgagaggtgactcacat < 1:553268‑M2/70‑68 (MQ=255) aCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacat < 1:1115044‑M2/70‑68 (MQ=255) aCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacat < 1:1252907‑M2/70‑68 (MQ=255) aCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacat < 1:1052912‑M2/70‑68 (MQ=255) aCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagagg < 1:3535834‑M2/60‑58 (MQ=255) aCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagagg < 1:1313356‑M2/60‑58 (MQ=255) | CCATCATTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTAT > W3110S.gb/576842‑576980 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |