| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 436259 = | 45 (0.950) | 482 (10.990) | 48/96 | NT | 92.6% | intergenic (‑156/‑29) | ybfF/seqA | conserved hypothetical protein/regulatory protein for replication initiation |
| ? | minE | = 2706018 | 36 (0.820) | coding (836/837 nt) | dam | DNA adenine methylase | |||||
Only 100 of 696 total aligned reads displayed.
GTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATA > minE/436191‑436327 | acacgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa > 1:1162535‑M1/69‑69 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataAtt < 1:2002087‑M1/3‑1 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTc < 1:1054684‑M1/4‑1 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTc > 1:1088696‑M1/66‑69 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTc < 1:2546830‑M1/4‑1 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTc < 1:2255692‑M1/4‑1 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTc > 1:2053438‑M1/66‑69 (MQ=255) gtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcccccgcgaaaaaataATTCa < 1:1908802‑M1/5‑1 (MQ=255) gtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCa < 1:1396330‑M1/5‑1 (MQ=255) aaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAg < 1:2149136‑M1/6‑1 (MQ=255) aaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa > 1:1546392‑M1/60‑69 (MQ=255) ggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa > 1:982220‑M1/58‑69 (MQ=255) ggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa > 1:3047340‑M1/58‑69 (MQ=255) ggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa > 1:2954142‑M1/58‑69 (MQ=255) ggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa > 1:1454970‑M1/58‑69 (MQ=255) aGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTaa < 1:1346793/67‑1 (MQ=255) gtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGac < 1:1490202‑M1/13‑1 (MQ=255) gtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGac > 1:749128‑M1/57‑69 (MQ=255) gtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGac < 1:156909‑M1/13‑1 (MQ=255) gtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGac > 1:3022310‑M1/57‑69 (MQ=255) gtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGac > 1:1869825‑M1/57‑69 (MQ=255) tggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGaca > 1:867228‑M1/56‑69 (MQ=255) tggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGaca > 1:2021839‑M1/56‑69 (MQ=255) tggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGaca < 1:2375865‑M1/14‑1 (MQ=255) tggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGaca > 1:1319452‑M1/56‑69 (MQ=255) tggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGaca > 1:1821409‑M1/56‑69 (MQ=255) gacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGacac < 1:3155619‑M1/15‑1 (MQ=255) gacgaactgctggctttgtacaaaccaggaggcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGacac < 1:3072743‑M1/15‑1 (MQ=255) acgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa > 1:2753023‑M1/53‑64 (MQ=255) cgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa > 1:326319‑M1/52‑61 (MQ=255) cgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgc > 1:3426855‑M1/52‑69 (MQ=255) cgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactg > 1:1067330‑M1/52‑68 (MQ=255) cgaactgctggctttgtacaaacaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgc > 1:3131488‑M1/51‑68 (MQ=255) cgaactgctggctttgtacaaacaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgc > 1:933197‑M1/51‑68 (MQ=255) cgaactgctggctttgtacaaacaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgc > 1:3332210‑M1/51‑68 (MQ=255) ctgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCt < 1:659848‑M1/8‑1 (MQ=255) ctgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCt > 1:2445803‑M1/48‑55 (MQ=255) ctgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCt < 1:612152‑M1/8‑1 (MQ=255) ctgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgcactg < 1:1111462‑M1/22‑1 (MQ=255) ctgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgcactg > 1:1029004‑M1/48‑69 (MQ=255) ctgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgcactg > 1:1621703‑M1/48‑69 (MQ=255) tgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgcactg > 1:899150‑M1/47‑68 (MQ=255) gctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa > 1:3180098‑M1/46‑57 (MQ=255) gctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTgg < 1:1597879‑M1/23‑1 (MQ=255) ggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTgg < 1:281763‑M1/23‑1 (MQ=255) ggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGa < 1:1259454‑M1/24‑1 (MQ=255) tttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTaa > 1:2968490‑M1/40‑67 (MQ=255) tttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTaa > 1:2663065‑M1/40‑67 (MQ=255) tttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTaa > 1:2600346‑M1/40‑67 (MQ=255) tacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa < 1:2869803‑M1/34‑1 (MQ=255) tacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa < 1:3212825‑M1/34‑1 (MQ=255) aaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc > 1:1961303‑M1/32‑68 (MQ=255) aaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACg < 1:3286734‑M1/38‑1 (MQ=255) gagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGaa < 1:1741936‑M1/44‑1 (MQ=255) agtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc > 1:2472425‑M1/25‑61 (MQ=255) gtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTgaat < 1:2623695‑M1/45‑2 (MQ=255) tcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt < 1:2111186‑M1/47‑1 (MQ=255) cgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtg < 1:1709443‑M1/48‑1 (MQ=255) cgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtg < 1:2296581‑M1/48‑1 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtg < 1:821484‑M1/48‑1 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtg < 1:1506293‑M1/48‑1 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtg < 1:2579242‑M1/48‑1 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtg < 1:635767‑M1/48‑1 (MQ=255) ttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatg > 1:1303012‑M1/19‑69 (MQ=255) ttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatg > 1:379286‑M1/19‑69 (MQ=255) ttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatg > 1:1925891‑M1/19‑69 (MQ=255) ttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat > 1:1422624‑M1/19‑68 (MQ=255) ttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat > 1:1781456‑M1/19‑68 (MQ=255) ttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat > 1:2725128‑M1/19‑68 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatg < 1:717774‑M1/51‑1 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatg < 1:1201402‑M1/51‑1 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatg < 1:2351663‑M1/51‑1 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatg < 1:1633833‑M1/51‑1 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtg > 1:2775075‑M1/18‑65 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtg > 1:2890463‑M1/18‑65 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatg > 1:3101186/1‑68 (MQ=255) cccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACTATTGAAGTtgatgatg > 1:2983023‑M1/15‑68 (MQ=255) cccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:100112‑M1/15‑68 (MQ=255) cccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:2090075‑M1/15‑68 (MQ=255) ccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa > 1:1225549‑M1/14‑69 (MQ=255) ccTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatga < 1:359624/68‑1 (MQ=255) ccTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatga < 1:2188040/68‑1 (MQ=255) ccTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatga < 1:2219558/68‑1 (MQ=255) cgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa > 1:522141‑M1/13‑68 (MQ=255) aaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa > 1:1673505‑M1/9‑69 (MQ=255) aaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa > 1:465622‑M1/9‑69 (MQ=255) aaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACa > 1:547820‑M1/7‑69 (MQ=255) taATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta > 1:2520939‑M1/3‑69 (MQ=255) 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ATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta < 1:23183‑M1/67‑1 (MQ=255) ATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta < 1:2411902‑M1/67‑1 (MQ=255) | GTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATA > minE/436191‑436327 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |