| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 436259 = | 45 (0.950) | 482 (10.990) | 48/96 | NT | 92.6% | intergenic (‑156/‑29) | ybfF/seqA | conserved hypothetical protein/regulatory protein for replication initiation |
| ? | minE | = 2706018 | 36 (0.820) | coding (836/837 nt) | dam | DNA adenine methylase | |||||
Only 100 of 682 total aligned reads displayed.
ACACGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGATTTTGCCCG > minE/2705951‑2706086 | acacGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAa > 1:2023565‑M2/1‑68 (MQ=255)acacGTAAAAAGGGGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAa > 1:127223‑M2/1‑68 (MQ=255) cGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattc > 1:3315404‑M2/1‑65 (MQ=255) cGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattc < 1:2743665‑M2/69‑5 (MQ=255) cGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattc < 1:1066813‑M2/69‑5 (MQ=255) cGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattc < 1:2300967‑M2/69‑5 (MQ=255) cGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattc < 1:742247‑M2/69‑5 (MQ=255) cGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattc > 1:1915903‑M2/1‑65 (MQ=255) cGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattc < 1:2507322‑M2/69‑5 (MQ=255) cGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCAGCGAAAAAATAattc < 1:2618475‑M2/69‑5 (MQ=255) aaaaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcag < 1:199824‑M2/67‑7 (MQ=255) aaaaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcag < 1:1492100‑M2/67‑7 (MQ=255) aaaaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcag < 1:131141‑M2/67‑7 (MQ=255) aaaaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcag < 1:2835596‑M2/67‑7 (MQ=255) aaaaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattca < 1:2724911‑M2/66‑6 (MQ=255) aGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaa > 1:690570‑M2/1‑58 (MQ=255) ggTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:3047340‑M2/1‑57 (MQ=255) ggTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:1428147‑M2/1‑57 (MQ=255) ggTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:1401524‑M2/1‑57 (MQ=255) ggTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:944088‑M2/1‑57 (MQ=255) ggTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:982220‑M2/1‑57 (MQ=255) gTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagac > 1:1869825‑M2/1‑56 (MQ=255) gTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagac < 1:2204361‑M2/69‑14 (MQ=255) gTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagac > 1:2856519‑M2/1‑56 (MQ=255) gTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagac < 1:3105403‑M2/69‑14 (MQ=255) gTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagac > 1:368208‑M2/1‑56 (MQ=255) gTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagac < 1:1086700‑M2/69‑14 (MQ=255) gTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGgaga < 1:463456/69‑1 (MQ=255) gTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGgaga < 1:1134315/69‑1 (MQ=255) tGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagaca < 1:1556946‑M2/69‑15 (MQ=255) tGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagaca > 1:2366814‑M2/1‑55 (MQ=255) ggACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacac < 1:1643520‑M2/69‑16 (MQ=255) gACGAACTGCTGGCTTTTTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGc < 1:425638/69‑1 (MQ=255) gACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacac < 1:3155619‑M2/68‑16 (MQ=255) gACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGGCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacac < 1:3072743‑M2/68‑16 (MQ=255) cGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgc > 1:3426855‑M2/1‑51 (MQ=255) cGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCg < 1:1725760/68‑1 (MQ=255) cGAACTGCTGGCTTTGTACAAAC‑AGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgc > 1:2763047‑M2/1‑50 (MQ=255) cGAACTGCTGGCTTTGTACAAAC‑AGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgc > 1:254335‑M2/1‑50 (MQ=255) gAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactg > 1:1942779‑M2/1‑50 (MQ=255) ctgctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAaata < 1:301555/47‑1 (MQ=255) ctgctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactg > 1:927184‑M2/1‑47 (MQ=255) ctgctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactg < 1:2599583‑M2/69‑23 (MQ=255) ctgctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactg > 1:1621703‑M2/1‑47 (MQ=255) ctgctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgca < 1:1106922‑M2/66‑20 (MQ=255) ctgctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaa > 1:1357319‑M2/1‑47 (MQ=255) ctgctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaa > 1:168010‑M2/1‑47 (MQ=255) ctgctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagct < 1:2965202‑M2/55‑9 (MQ=255) ctgctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagct < 1:659848‑M2/55‑9 (MQ=255) gctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAaata > 1:3133829/1‑45 (MQ=255) gctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactgg < 1:148609‑M2/68‑24 (MQ=255) gctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:3180098‑M2/1‑45 (MQ=255) gctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:3237905‑M2/1‑45 (MQ=255) gctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:2096164‑M2/1‑45 (MQ=255) ctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:896375‑M2/1‑44 (MQ=255) ggCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactgg < 1:1782231‑M2/65‑24 (MQ=255) tttGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaag < 1:2579194‑M2/68‑30 (MQ=255) tACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaa < 1:3212825‑M2/69‑35 (MQ=255) tACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagcaaagacactgcact < 1:2945735‑M2/56‑22 (MQ=255) aaCCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaac > 1:1961303‑M2/1‑31 (MQ=255) aaCCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaac > 1:2398737‑M2/1‑31 (MQ=255) aaCCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGc < 1:1322337/69‑1 (MQ=255) ccAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgat > 1:1528752‑M2/1‑29 (MQ=255) aGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattg > 1:3333092‑M2/1‑27 (MQ=255) ggAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattga > 1:401816‑M2/1‑26 (MQ=255) gAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaa < 1:1584744‑M2/69‑45 (MQ=255) aGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaag > 1:2228756‑M2/1‑24 (MQ=255) aGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaac > 1:2643122‑M2/1‑24 (MQ=255) aGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaac > 1:517123‑M2/1‑24 (MQ=255) gTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaag < 1:2126356‑M2/68‑46 (MQ=255) tCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagtt < 1:2885396‑M2/69‑48 (MQ=255) tCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagtt > 1:3381627‑M2/1‑22 (MQ=255) tCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagtt < 1:1207766‑M2/69‑48 (MQ=255) gTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttg < 1:1036884‑M2/68‑49 (MQ=255) gTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttg < 1:2907744‑M2/68‑49 (MQ=255) gTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttg < 1:3264660‑M2/68‑49 (MQ=255) gTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttg < 1:821484‑M2/68‑49 (MQ=255) gTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttg < 1:1184559‑M2/68‑49 (MQ=255) gTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttg < 1:635767‑M2/68‑49 (MQ=255) gTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttg < 1:2468304‑M2/68‑49 (MQ=255) gTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTc > 1:1821196/1‑69 (MQ=255) ttCACCCTCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatg > 1:233561‑M2/1‑18 (MQ=255) ttCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatg > 1:2440045‑M2/1‑18 (MQ=255) ttCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatg > 1:2157193‑M2/1‑18 (MQ=255) ttCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgat > 1:612718‑M2/1‑18 (MQ=255) ttCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgat > 1:1508475‑M2/1‑18 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatg < 1:1235387‑M2/68‑52 (MQ=255) cccGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatg > 1:100112‑M2/1‑14 (MQ=255) cccGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatg > 1:3291474‑M2/1‑14 (MQ=255) cccGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatg > 1:2979445‑M2/1‑14 (MQ=255) ccGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaa > 1:2060924‑M2/1‑13 (MQ=255) ccGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaa > 1:281558‑M2/1‑13 (MQ=255) aaaaaTAattcagctatgacactgcactggattaagatgaaaac > 1:1749616‑M2/1‑7 (MQ=255) aaaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctaca > 1:2282341‑M2/1‑6 (MQ=255) aataattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagc > 1:1606991‑M2/1‑4 (MQ=255) taattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagcta > 1:585551‑M2/1‑2 (MQ=255) taattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagcta > 1:785065‑M2/1‑2 (MQ=255) taattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagcta > 1:854446‑M2/1‑2 (MQ=255) taattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagcta > 1:1058224‑M2/1‑2 (MQ=255) aattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagctat > 1:546760‑M2/1‑1 (MQ=255) | ACACGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGATTTTGCCCG > minE/2705951‑2706086 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |