Missing coverage evidence...
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GGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCT  >  minE/1378706‑1378775 |                                                                      ggCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCt  <  1:2365716/70‑1 (MQ=255) ggCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCt  <  1:515138/70‑1 (MQ=255) ggCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCt  <  1:469403/70‑1 (MQ=255) ggCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCt  <  1:2882963/70‑1 (MQ=255) ggCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCt  <  1:2861231/70‑1 (MQ=255) ggCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCt  <  1:2639220/70‑1 (MQ=255) ggCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCt  <  1:2499958/70‑1 (MQ=255) ggCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCt  <  1:2420637/70‑1 (MQ=255) ggCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCt  <  1:1293504/70‑1 (MQ=255) ggCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCt  <  1:2345168/70‑1 (MQ=255) ggCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCt  <  1:2005180/70‑1 (MQ=255) ggCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCt  <  1:2001699/70‑1 (MQ=255) ggCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCt  <  1:1901276/70‑1 (MQ=255) ggCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCt  <  1:1825898/70‑1 (MQ=255) ggCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCt  <  1:1558631/70‑1 (MQ=255) ggCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCt  <  1:1430543/70‑1 (MQ=255) ggCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCAGTATCt  <  1:404244/70‑1 (MQ=255) |                                                                      GGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCT  >  minE/1378706‑1378775

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑