Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2954081	2954382	302	36 [0]	[0] 31	[holD]	[holD]

CTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAG  >  minE/2954011‑2954080                                                                      | cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:544701/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:389235/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:390539/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:405957/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:502164/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:503854/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:506995/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:511642/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:525462/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:387254/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:563425/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:585070/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:593352/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:598601/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:60990/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:634616/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:66021/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:66193/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:219866/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:113146/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:125554/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:128245/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:129238/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:131325/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:142597/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:146797/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:172617/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:102663/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:276024/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:291992/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:312564/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:314817/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:328446/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:341017/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:344208/1‑70 (MQ=255) cTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAg  >  1:384720/1‑70 (MQ=255)                                                                      | CTGGCGGCGATTATAGCCATATGTTGGCGCGGTATCGACGAATTTGCTATATTTGCGCCCCTGACAACAG  >  minE/2954011‑2954080

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑