Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1317740 1317745 6 132 [0] [7] 8 cld regulator of length of O‑antigen component of lipopolysaccharide chains

Only 100 of 132 total aligned reads displayed.

AGCACCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATCAC  >  minE/1317669‑1317739
                                                                      |
agcaCCGCCAGTATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:51994/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATTGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:604025/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCTTcac  <  1:634506/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:500104/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:59589/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:538105/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:53636/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:53198/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:524949/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:51629/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:503522/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:502042/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:636356/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:488979/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:482561/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:482156/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:469871/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:460171/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:450790/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:429548/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:389108/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1020214/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:372745/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:342615/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:833709/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:978206/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:976343/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:973148/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:952031/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:946347/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:927406/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:922546/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:893700/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:875018/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:842328/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:833789/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:38141/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:831769/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:799352/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:795777/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:756970/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:727002/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:720587/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:68608/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:684302/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:679067/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:670995/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:645005/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1292346/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1059530/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1478520/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1473526/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1468690/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1083623/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1420298/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1348217/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1345424/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1332604/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1305197/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1481378/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1100941/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1290737/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1259298/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:125181/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1114833/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1192153/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1152794/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1123758/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1152020/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:222123/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:333748/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:315154/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:305900/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:252292/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:251231/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:234885/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:231123/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:230190/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1497280/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1036003/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:174218/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:172563/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1559115/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1550686/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1521597/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1509249/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1507425/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1502044/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGCTTTCATcac  <  1:1214049/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGCTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1241349/71‑1 (MQ=255)
 gcaCCGCCAGAATCAATGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:393146/70‑1 (MQ=255)
 gcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:316075/70‑1 (MQ=255)
 gcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:877788/70‑1 (MQ=255)
 gcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:119469/70‑1 (MQ=255)
 gcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:189507/70‑1 (MQ=255)
  caCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:144339/69‑1 (MQ=255)
                    aaTTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:114532/51‑1 (MQ=255)
                       tGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:936115/48‑1 (MQ=255)
                             tttCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:566607/42‑1 (MQ=255)
                               tCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:738032/40‑1 (MQ=255)
                                                                      |
AGCACCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATCAC  >  minE/1317669‑1317739

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑