Missing coverage evidence...
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CATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCA  >  minE/2401817‑2401887                                                                       | cATAACCCACTCTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:1072852/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:705667/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:483530/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:48980/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:496835/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:519537/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:543534/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:609750/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:620701/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:628052/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:638684/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:461432/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:75137/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:787133/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:816000/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:879181/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:901091/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:909640/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:917603/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:959042/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:1389222/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:1025069/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:1090293/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:1130023/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:1145714/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:1173175/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:1180127/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:1221628/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:1303200/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:465338/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:1395022/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:1409202/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:156360/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:255467/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:289876/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:292453/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:339519/71‑1 (MQ=255) cATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:1016771/71‑1 (MQ=255)  aTAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCa  <  1:1182483/70‑1 (MQ=255)                                                                       | CATAACCCACACTTCACCAGACTCCAGGTCGAGGTGTTTAATATCCAGCCCCACCAGCTCAGAAAGACGCA  >  minE/2401817‑2401887

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑