Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2816209	2816258	50	62 [0]	[0] 47	[soxS]	[soxS]

ATAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAATAT  >  minE/2816159‑2816208                                                  | aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATTAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:761515/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTTGTCAatat  <  1:671067/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:67937/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:395197/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1017587/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:486688/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:491250/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:504024/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:532181/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:550300/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:551516/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:581926/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:618005/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:61805/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:628410/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:665595/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:448049/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:6860/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:725322/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:727092/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:763427/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:771491/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:793398/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:815080/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:820427/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:836696/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:845597/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:908741/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:91125/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:991040/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1330758/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1047897/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1054648/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1059577/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1085386/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1088432/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1111620/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1112243/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1112544/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1115275/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1166928/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1208599/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1297934/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1328719/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:374532/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1446729/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:369167/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:338440/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:265721/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:26418/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:263254/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:244235/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:201403/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:174168/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1560266/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1511399/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1483254/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1463402/50‑1 (MQ=255) aTAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:1430694/50‑1 (MQ=255)  tAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:552273/49‑1 (MQ=255)        gATTTTTTTGCGACTAGATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:772885/43‑1 (MQ=255)         aTTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAatat  <  1:761873/42‑1 (MQ=255)                                                  | ATAGCCTGATTTTTTTGCGACTACATCAATGTTAAGCGGCTGGTCAATAT  >  minE/2816159‑2816208

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑