Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2816209	2816258	50	62 [0]	[0] 47	[soxS]	[soxS]

AATCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTT  >  minE/2816259‑2816327 |                                                                     aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCt                                >  1:834698/1‑39 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCt                                >  1:587789/1‑39 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGtt                             >  1:299960/1‑42 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:715542/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:46369/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:470629/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:50870/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:54726/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:618394/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:622099/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:64187/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:673409/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:710000/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:417643/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:731205/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:75892/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:777482/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:780302/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:782305/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:800313/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:837791/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:848911/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:848941/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:97063/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:385652/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:1034073/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:1041778/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:1055513/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:1058368/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:1082205/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:1113541/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:1114482/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:1118040/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:1151241/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:1224437/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:1246598/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:147819/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:1487760/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:1510157/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:20296/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:301982/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:328994/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACtt  >  1:1023656/1‑69 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACt   >  1:1381232/1‑68 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACt   >  1:250226/1‑68 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACt   >  1:266114/1‑68 (MQ=255) aaTCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTACTCAAGTTAACtt  >  1:519775/1‑69 (MQ=255) |                                                                     AATCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTT  >  minE/2816259‑2816327

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑