Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1317628 1317668 41 94 [0] [0] 121 cld regulator of length of O‑antigen component of lipopolysaccharide chains

Only 100 of 121 total aligned reads displayed.

AGCACCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATCAC  >  minE/1317669‑1317739
|                                                                      
agcaCCGCCAGTATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:51994/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCTTcac  <  1:634506/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:503522/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:636356/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:62911/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:59589/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:549261/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:538105/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:53636/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:53198/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:524949/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:51629/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:514622/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:645005/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:500104/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:495392/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:488979/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:482561/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:470623/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:469871/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:460171/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:450790/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:442254/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:389108/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:38141/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:833709/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:978206/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:976343/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:973148/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:967655/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:946347/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:935855/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:927406/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:922546/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:893700/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:842328/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:838268/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:833789/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:38121/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:831769/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:799352/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:795777/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:756970/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:751895/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:727002/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:690376/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:68608/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:684302/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:679067/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:657269/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:125181/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1020214/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1469939/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1420298/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1404583/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1348217/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1345424/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1328241/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1305197/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1292346/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1290737/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:127771/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1473526/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1240139/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1192153/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1152794/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1152020/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1124334/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1123758/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1114833/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1092826/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1083623/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1059530/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1036003/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1481378/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:372745/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:342615/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:319699/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:315154/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:305900/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:286548/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:252292/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:234885/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:233351/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:231123/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:230190/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:203389/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:174218/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:172563/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:165648/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1559115/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1521597/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1514111/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1509249/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1507425/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1502044/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1497280/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1478520/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGCTTTCATcac  <  1:1214049/71‑1 (MQ=255)
agcaCCGCCAGAATCAAGCTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATcac  <  1:1241349/71‑1 (MQ=255)
|                                                                      
AGCACCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATCAC  >  minE/1317669‑1317739

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑