Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2543656	2543667	12	46 [0]	[0] 20	rfaL	O‑antigen ligase

GCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTAA  >  minE/2543668‑2543720 |                                                     gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:184437/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:740371/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:694100/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:486697/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:465223/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:434277/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:41620/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:302071/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:23122/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:196306/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:101216/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:1538822/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:1521362/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:1476807/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:1450222/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:1274142/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:1254771/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:1170611/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:1136425/1‑53 (MQ=255) gCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTaa  >  1:1084782/1‑53 (MQ=255) |                                                     GCACCTAGGGAAGTAACACTATTAGCATTGGTATAACTGTTTAAGTCATTTAA  >  minE/2543668‑2543720

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑