Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1207318 1207323 6 28 [0] [0] 9 manY mannose‑specific enzyme IIC component of PTS

TATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCA  >  minE/1207252‑1207317
                                                                 |
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:2009420/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:984283/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:953413/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:848039/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:808768/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:757007/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:665011/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:539100/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:499960/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:465618/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:27539/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:2303042/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:2276098/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:2124282/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:1123284/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:2004792/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:19612/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:193981/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:1846421/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:1840329/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:1725136/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:1692904/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:1663185/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:1630232/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:153220/66‑1 (MQ=255)
tATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:1207409/66‑1 (MQ=255)
 aTCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCa  <  1:1536641/65‑1 (MQ=255)
                cgCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCGGAGGGCCa  <  1:1577157/49‑1 (MQ=38)
                                                                 |
TATCGCAGGTCATCAGAGCATTGGTGCAGGTATCGCACTGGCAATCCCTCTGGCCGCTGCGGGCCA  >  minE/1207252‑1207317

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: