| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 1886614 | 73 (1.170) | 35 (0.680) +AAGACAAAT |
5/82 | NT | 29.1% | coding (2076/2757 nt) | barA | hybrid sensory histidine kinase, in two‑component regulatory system with UvrY |
| ? | minE | = 2149918 | 136 (2.170) | coding (87/849 nt) | folP | 7,8‑dihydropteroate synthase | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
ATGGCGGTTGATGACAACCCCGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACAGATGCCGTTCGATTTGATCTT > minE/1886549‑1886685 | gCGGTTGATGACAACCCCGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTgg > 1:3286725/1‑70 (MQ=255) gCGGTTGATGACAACCCCGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTgg > 1:1211467/1‑70 (MQ=255) gCGGTTGATGACAACCCCGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTgg < 1:2784049/70‑1 (MQ=255) gCGGTTGATGACAACCCCGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTgg > 1:479482/1‑70 (MQ=255) ttGATGACAACCCCGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGTTGCAACATGTGGAACtt < 1:2149675/71‑1 (MQ=255) ttGATGACAACCCCGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACtt < 1:189240/71‑1 (MQ=255) tgatgaCAACCCCGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACttt > 1:122413/1‑71 (MQ=255) atgaCAACCCCGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGc < 1:702143/71‑1 (MQ=255) atgaCAACCCCGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGc < 1:4017911/71‑1 (MQ=255) atgaCAACCCCGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGc < 1:4019256/71‑1 (MQ=255) tgaCAACCCCGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGc > 1:640588/1‑70 (MQ=255) tgaCAACCCCGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGc > 1:3756462/1‑70 (MQ=255) tgaCAACCCCGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGc > 1:2008934/1‑70 (MQ=255) cAACCCCGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGa > 1:1345397/1‑69 (MQ=255) cccGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCg < 1:441014/64‑1 (MQ=255) cGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGc < 1:3476290/71‑1 (MQ=255) cGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGc < 1:116430/71‑1 (MQ=255) cTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGc < 1:1335984/59‑1 (MQ=255) cTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGc < 1:3940992/59‑1 (MQ=255) cTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGc < 1:3974332/59‑1 (MQ=255) cTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGc < 1:2207348/59‑1 (MQ=255) cTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCAt < 1:2136668/71‑1 (MQ=255) cTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCAt < 1:2995987/71‑1 (MQ=255) aaCCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCaa > 1:3154617/1‑42 (MQ=255) aCCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACAt > 1:3667883/1‑44 (MQ=255) aCCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCg < 1:2589092/63‑1 (MQ=255) aCCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCg < 1:3393706/63‑1 (MQ=255) aCCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCg < 1:1006839/63‑1 (MQ=255) aCCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCg < 1:1561393/63‑1 (MQ=255) aCCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAg > 1:1253529/1‑71 (MQ=255) ccTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCAt < 1:3223118/67‑1 (MQ=255) ccTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCAt < 1:3152493/67‑1 (MQ=255) cTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGc < 1:1819071/60‑1 (MQ=255) gAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCgg > 1:3668841/1‑71 (MQ=255) aCTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTg < 1:2265591/71‑1 (MQ=255) aCTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTg < 1:3082053/71‑1 (MQ=255) aCTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTg < 1:3264135/71‑1 (MQ=255) aCTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTg < 1:68361/71‑1 (MQ=255) tCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACgg < 1:2466071/71‑1 (MQ=255) ggCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACtt < 1:3190586/39‑1 (MQ=255) cgcATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGa < 1:4017818/71‑1 (MQ=255) cgcATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGa < 1:3015276/71‑1 (MQ=255) cgcATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGa < 1:1190926/71‑1 (MQ=255) cgcATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGa < 1:1327421/71‑1 (MQ=255) cgcATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGa < 1:4125438/71‑1 (MQ=255) gcATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGa > 1:1124641/1‑70 (MQ=255) gcATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGa > 1:2035375/1‑70 (MQ=255) ttGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGaaa > 1:650357/1‑69 (MQ=255) ttGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGaaa > 1:3891934/1‑69 (MQ=255) ttGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACa < 1:2609178/71‑1 (MQ=255) gCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGAt > 1:2539670/1‑37 (MQ=255) gCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCg > 1:275668/1‑41 (MQ=255) gCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGaaa > 1:3080645/1‑67 (MQ=255) cTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACAGAt < 1:358573/71‑1 (MQ=255) tgaAGATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggcatag > 1:3605135‑M1/2‑16 (MQ=255) tgaAGATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggcatag > 1:3239722‑M1/2‑16 (MQ=255) tgaAGATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggcatag > 1:1007433‑M1/2‑16 (MQ=255) tgaAGATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggcatag > 1:2630455‑M1/2‑16 (MQ=255) tgaAGATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggcatag > 1:2668358‑M1/2‑16 (MQ=255) tgaAGATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggcatag > 1:1194410‑M1/2‑16 (MQ=255) tgaAGATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggca > 1:2788431‑M1/2‑16 (MQ=255) gAAGATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggcata > 1:1880693‑M1/1‑15 (MQ=255) gAAGATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggcata > 1:3957927‑M1/1‑15 (MQ=255) gAAGATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggcata > 1:3735985‑M1/1‑15 (MQ=255) gAAGATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggca < 1:2333203‑M1/39‑25 (MQ=255) gAAGATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggca < 1:2820464‑M1/35‑21 (MQ=255) gAAGATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggca < 1:2242213‑M1/35‑21 (MQ=255) aGATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggcata > 1:1293438‑M1/1‑13 (MQ=255) aGATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggcata > 1:3980214‑M1/1‑13 (MQ=255) aGATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggcata > 1:1356281‑M1/1‑13 (MQ=255) aGATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggcat > 1:354070‑M1/1‑13 (MQ=255) gATATGGTGCAAaagacaaattgatggtggcatgca < 1:3364532‑M1/36‑25 (MQ=255) gATATGGTGCAAaagacaaatggatggtgggaggcata > 1:1681657‑M1/1‑12 (MQ=255) gATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggcatagt > 1:2916567‑M1/1‑12 (MQ=255) gATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggcata > 1:105439‑M1/1‑12 (MQ=255) gATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggcata > 1:3192585‑M1/1‑12 (MQ=255) gATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggca < 1:791583‑M1/36‑25 (MQ=255) gATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggca < 1:1912492‑M1/36‑25 (MQ=255) gATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggca < 1:2969002‑M1/36‑25 (MQ=255) gATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggca < 1:2183026‑M1/36‑25 (MQ=255) gATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggca < 1:2303886‑M1/36‑25 (MQ=255) gATATGGTGCAAaagacaaatggatggtggcaggca < 1:426633‑M1/36‑25 (MQ=255) atatGGTGCAACATGTGTAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGa < 1:3566101/57‑1 (MQ=255) tatGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACATATGCCGTTCg < 1:3728782/71‑1 (MQ=255) tatGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACAGATGCCGTTc > 1:948670/1‑70 (MQ=255) tatGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACAGATGCCGTTc > 1:1727691/1‑70 (MQ=255) tatGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACAGATGCCGTTc > 1:3817492/1‑70 (MQ=255) tatGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACAGATGCCGTTc > 1:2487701/1‑70 (MQ=255) atGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACAGATGCCGTTCGa > 1:1258884/1‑71 (MQ=255) tGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACAGATGCCGTTCGATTTg < 1:3537745/71‑1 (MQ=255) cAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACAGATGCCGTTCGAt < 1:1254209/66‑1 (MQ=255) cAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACAGATGCCGTTCGAt < 1:675255/66‑1 (MQ=255) cAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACAGATGCCGTTCGAt < 1:947365/66‑1 (MQ=255) aCATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGTTTGAACGGGCGAAACAGATGCCGTTCGAttt > 1:3454652/1‑66 (MQ=255) aCATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACTGGCGAAACAGATGCCGTTCGAttt > 1:796046/1‑66 (MQ=255) aCATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACAGATGCCGtta > 1:1624290/1‑60 (MQ=255) aCATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACAGATGCCGTTCGAttt > 1:3439663/1‑66 (MQ=255) aCATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACAGATGCCGTTCGAttt > 1:2804681/1‑66 (MQ=255) aCATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACAGATGCCGTTCGAttt > 1:3273804/1‑66 (MQ=255) aCATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACAGATGCC‑TTCGATTTGATCtt < 1:3662692/71‑1 (MQ=255) | ATGGCGGTTGATGACAACCCCGCTAACCTGAAACTTATCGGCGCATTGCTGGAAGATATGGTGCAACATGTGGAACTTTGCGATAGCGGGCATCAGGCGGTTGAACGGGCGAAACAGATGCCGTTCGATTTGATCTT > minE/1886549‑1886685 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |