Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1206689	1206693	5	12 [0]	[0] 24	manX	fused mannose‑specific PTS enzyme IIAB components

GCCAAAATGATTCGCGTCTACAACAACCCGAAATATGCTGGCGAACGCGTAATGCT  >  minE/1206633‑1206688                                                        | gCCAAAATGATTCGCGTCTACAACAACCCGAAATATGCTGGCGAACGCGTAATGCt  >  1:1019486/1‑56 (MQ=255) gCCAAAATGATTCGCGTCTACAACAACCCGAAATATGCTGGCGAACGCGTAATGCt  >  1:1158079/1‑56 (MQ=255) gCCAAAATGATTCGCGTCTACAACAACCCGAAATATGCTGGCGAACGCGTAATGCt  >  1:1159308/1‑56 (MQ=255) gCCAAAATGATTCGCGTCTACAACAACCCGAAATATGCTGGCGAACGCGTAATGCt  >  1:11598/1‑56 (MQ=255) gCCAAAATGATTCGCGTCTACAACAACCCGAAATATGCTGGCGAACGCGTAATGCt  >  1:142046/1‑56 (MQ=255) gCCAAAATGATTCGCGTCTACAACAACCCGAAATATGCTGGCGAACGCGTAATGCt  >  1:1450073/1‑56 (MQ=255) gCCAAAATGATTCGCGTCTACAACAACCCGAAATATGCTGGCGAACGCGTAATGCt  >  1:1801162/1‑56 (MQ=255) gCCAAAATGATTCGCGTCTACAACAACCCGAAATATGCTGGCGAACGCGTAATGCt  >  1:357926/1‑56 (MQ=255) gCCAAAATGATTCGCGTCTACAACAACCCGAAATATGCTGGCGAACGCGTAATGCt  >  1:608981/1‑56 (MQ=255) gCCAAAATGATTCGCGTCTACAACAACCCGAAATATGCTGGCGAACGCGTAATGCt  >  1:748828/1‑56 (MQ=255) gCCAAAATGATTCGCGTCTACAACAACCCGAAATATGCTGGCGAACGCGTAATGCt  >  1:75997/1‑56 (MQ=255)                   tACAACAACCCGAAATATGCTGGCGAACGCGTAATGCt  <  1:1678672/38‑1 (MQ=255)                                                        | GCCAAAATGATTCGCGTCTACAACAACCCGAAATATGCTGGCGAACGCGTAATGCT  >  minE/1206633‑1206688

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑