Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2342837	2342877	41	35 [0]	[0] 36	glnL	sensory kinase in two‑component regulatory system with GlnG

TGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTA  >  minE/2342878‑2342944 |                                                                   tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:2046371/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:177199/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1834110/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1836554/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1932899/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:2015453/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:2023027/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:2023927/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:2044693/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1181510/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:2059297/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:2096772/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:2124981/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:310298/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:351717/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:390986/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:712045/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:880109/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1601006/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1133379/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1187220/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1205968/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1217990/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1240619/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1244199/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1255908/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1327532/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:144736/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1450656/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1509745/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1524620/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1529293/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1575214/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1576689/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:1730094/67‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACATGCGGTTGATTCGTGATTa  <  1:89050/67‑1 (MQ=255) |                                                                   TGGCTGAACGCGTGGTAACGCTGGTGTCGATGGAACTGCCGGACAACGTGCGGTTGATTCGTGATTA  >  minE/2342878‑2342944

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑