| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 139618 | 68 (1.070) | 58 (1.210) +GTTTTGGTTTCG |
5/76 | NT | 54.2% | coding (549/2598 nt) | htrE | predicted outer membrane usher protein |
| ? | minE | = 389119 | 61 (0.960) | coding (637/1161 nt) | ybdL | methionine aminotransferase, PLP‑dependent | |||||
ACTATGATATCCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > minE/139603‑139618‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTGTGAAAAGTTG < minE/389119‑389106 |||||||||||| tgTATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT < 1:641001/39‑1tgTATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT < 1:558826/39‑1 TATGATATCCGTTTGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT < 1:3171275/39‑1 TATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT > 1:2299865/1‑39 TATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT > 1:3526190/1‑39 TATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT > 1:928753/1‑39 TATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAG > 1:1347875/1‑37 TATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAA > 1:2371177/1‑36 TATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAA > 1:2199992/1‑36 TATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAA > 1:3245791/1‑36 TATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAA > 1:2094161/1‑36 TATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAA > 1:985203/1‑36 TATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAA > 1:1659417/1‑36 TATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAA > 1:2473555/1‑36 TATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAA > 1:1506402/1‑35 TATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTCAAAAG > 1:557764/1‑37 ATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAGAAGTT < 1:253535/38‑1 ATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt < 1:946971/39‑2 ATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT < 1:631639/38‑1 ATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT < 1:3364805/38‑1 ATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT < 1:3160604/38‑1 ATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT < 1:2518511/38‑1 ATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT < 1:3810367/38‑1 ATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT < 1:3985721/38‑1 ATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT < 1:4213606/38‑1 ATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT < 1:1087600/38‑1 ATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAG < 1:2431391/36‑1 ATGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAG < 1:3434370/36‑1 ATGATATCCGTTGGTTTTGGCTTCGTTTGTGAAAAGTT < 1:3096204/38‑1 TGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt < 1:2291009/38‑2 TGATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt < 1:1060578/38‑2 GATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt > 1:4149623/1‑36 GATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt > 1:2894272/1‑36 GATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt < 1:3133201/37‑2 GATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt > 1:2257149/1‑36 GATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt > 1:2601750/1‑36 GATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt > 1:2050206/1‑36 GATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT < 1:214341/36‑1 GATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT < 1:1240018/36‑1 GATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT < 1:1305124/36‑1 GATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT < 1:3353414/36‑1 GATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT < 1:31275/36‑1 GATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGT < 1:3418322/35‑1 GATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGT < 1:2068629/35‑1 GATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGT < 1:793539/35‑1 ATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt > 1:989079/1‑35 ATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt > 1:686102/1‑35 ATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt > 1:4243411/1‑35 ATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt < 1:3438395/36‑2 ATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt > 1:2829201/1‑35 ATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt > 1:2808471/1‑35 ATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt > 1:174081/1‑35 ATATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTT > 1:1554269/1‑35 TATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt < 1:2721287/35‑2 TATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt > 1:262188/1‑34 TATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt < 1:2395212/35‑2 TATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt < 1:1750400/35‑2 TATCCGTTGGTTTTGGTTTCGGTTGTGAAAAGTTt < 1:1671844/35‑2 |||||||||||| ACTATGATATCCGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > minE/139603‑139618‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTGTGAAAAGTTG < minE/389119‑389106 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |