| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 139618 | 68 (1.070) | 58 (1.210) +GTTTTGGTTTCG |
5/76 | NT | 54.2% | coding (549/2598 nt) | htrE | predicted outer membrane usher protein |
| ? | minE | = 389119 | 61 (0.960) | coding (637/1161 nt) | ybdL | methionine aminotransferase, PLP‑dependent | |||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
ATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTCCCATAACGATGGATCAACATAGTTTTGGTAAT > minE/139550‑139688 | cACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTg < 1:1947789/71‑1 (MQ=255) cACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTg < 1:78296/71‑1 (MQ=255) aaaTGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGac > 1:2820908/1‑70 (MQ=255) aaTGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTTTGacaa < 1:5480/71‑1 (MQ=255) aaTGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGacaa < 1:2553432/71‑1 (MQ=255) aaTGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGacaa < 1:476259/71‑1 (MQ=255) aaTGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGacaa < 1:1442172/71‑1 (MQ=255) aaTGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGacaa < 1:717727/71‑1 (MQ=255) aaTGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGacaa < 1:1582600/71‑1 (MQ=255) aaTGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGaca < 1:456493/70‑1 (MQ=255) cagcaTAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACAt < 1:2435778/70‑1 (MQ=255) gcaTAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGa < 1:855953/52‑1 (MQ=255) aTAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAgg > 1:2158840/1‑52 (MQ=255) aTAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCg < 1:1006559/71‑1 (MQ=255) tAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGac < 1:2022269/60‑1 (MQ=255) tAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGac < 1:2087780/60‑1 (MQ=255) tAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGac < 1:947869/60‑1 (MQ=255) aaTGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCg < 1:2283859/68‑1 (MQ=255) aTGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAg > 1:1505151/1‑47 (MQ=255) aTGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCAtt < 1:504115/71‑1 (MQ=255) tGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTa < 1:3132019/71‑1 (MQ=255) tCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAAt > 1:4158090/1‑68 (MQ=255) tCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAAt > 1:3930612/1‑68 (MQ=255) tCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGcc > 1:2577099/1‑71 (MQ=255) tCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGcc > 1:3779769/1‑71 (MQ=255) tCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGcc > 1:3461871/1‑71 (MQ=255) cATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGac > 1:2911491/1‑50 (MQ=255) ttttttCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGacaa < 1:713401/50‑1 (MQ=255) ttttCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGacaaca > 1:982002/1‑50 (MQ=255) ttttCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTaa > 1:1179187/1‑62 (MQ=255) ttCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTcc > 1:965016/1‑71 (MQ=255) tCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTcc < 1:2940017/70‑1 (MQ=255) cAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTCCCATAAc < 1:3553723/71‑1 (MQ=255) ggggTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTGTGACAACATGGCCGCATTAATGc > 1:1116126/1‑55 (MQ=255) ggggTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAAt > 1:1405897/1‑53 (MQ=255) ggggTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATg < 1:49498/54‑1 (MQ=255) ggggTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATg < 1:3424075/54‑1 (MQ=255) ggggTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATg < 1:3311234/54‑1 (MQ=255) ggggTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATg < 1:2797269/54‑1 (MQ=255) ggggTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATg < 1:1857344/54‑1 (MQ=255) ggggTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGc > 1:940996/1‑55 (MQ=255) ggggTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGc > 1:251871/1‑55 (MQ=255) ggggTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGc > 1:3824289/1‑55 (MQ=255) ggggTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGc > 1:2649881/1‑55 (MQ=255) ggggTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGc > 1:897509/1‑55 (MQ=255) ggggTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTCCCa > 1:1012854/1‑65 (MQ=255) gggTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTCCCATAACGAt > 1:3704269/1‑71 (MQ=255) tgtatGATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagtt < 1:558826‑M1/39‑26 (MQ=255) tgtatGATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagtt < 1:641001‑M1/39‑26 (MQ=255) tATGATATCCGTTTgttttggtttcggttgtgaaaagtt < 1:3171275‑M1/39‑26 (MQ=255) tATGATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagtt > 1:2299865‑M1/1‑14 (MQ=255) tATGATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaa > 1:985203‑M1/1‑14 (MQ=255) tATGATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaa > 1:1659417‑M1/1‑14 (MQ=255) tATGATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaa > 1:2094161‑M1/1‑14 (MQ=255) tATGATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaa > 1:3245791‑M1/1‑14 (MQ=255) tATGATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaa > 1:2371177‑M1/1‑14 (MQ=255) tATGATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaa > 1:1506402‑M1/1‑14 (MQ=255) aTGATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagtt < 1:4213606‑M1/38‑26 (MQ=255) aTGATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagtt < 1:3364805‑M1/38‑26 (MQ=255) aTGATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagtt < 1:2518511‑M1/38‑26 (MQ=255) aTGATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagtt < 1:3160604‑M1/38‑26 (MQ=255) aTGATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagtt < 1:1087600‑M1/38‑26 (MQ=255) aTGATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaag < 1:2431391‑M1/36‑24 (MQ=255) aTGATATCCGTTGgttttggcttcgtttgtgaaaagtt < 1:3096204‑M1/38‑26 (MQ=255) tGATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagttt < 1:1060578‑M1/38‑27 (MQ=255) tGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTCCCATAACGATGGATCAACATa > 1:422518/1‑71 (MQ=255) gATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagttt > 1:4149623‑M1/1‑11 (MQ=255) gATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagttt > 1:2257149‑M1/1‑11 (MQ=255) gATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagttt < 1:3133201‑M1/37‑27 (MQ=255) gATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagtt < 1:1305124‑M1/36‑26 (MQ=255) gATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagtt < 1:214341‑M1/36‑26 (MQ=255) gATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagtt < 1:1240018‑M1/36‑26 (MQ=255) gATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagtt < 1:3353414‑M1/36‑26 (MQ=255) gATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagt < 1:793539‑M1/35‑25 (MQ=255) gATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagt < 1:2068629‑M1/35‑25 (MQ=255) gATATCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagt < 1:3418322‑M1/35‑25 (MQ=255) atatCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagttt > 1:2829201‑M1/1‑10 (MQ=255) atatCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagttt < 1:3438395‑M1/36‑27 (MQ=255) atatCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagttt > 1:686102‑M1/1‑10 (MQ=255) atatCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagttt > 1:4243411‑M1/1‑10 (MQ=255) atatCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagtt > 1:1554269‑M1/1‑10 (MQ=255) atatCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGttt > 1:4026806/1‑46 (MQ=255) atatCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGttt > 1:2022405/1‑46 (MQ=255) atatCCGTTGAGGGTGTATGACAACATGGCAGCATTAATGCCGttt > 1:943752/1‑46 (MQ=255) tatCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagttt < 1:1750400‑M1/35‑27 (MQ=255) tatCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagttt < 1:2721287‑M1/35‑27 (MQ=255) tatCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagttt > 1:262188‑M1/1‑9 (MQ=255) tatCCGTTGgttttggtttcggttgtgaaaagttt < 1:1671844‑M1/35‑27 (MQ=255) ttGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTcc < 1:2950766/42‑1 (MQ=255) ttGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTCCCATAACGATGGATCAACATAGTTTTGGTa < 1:3840329/71‑1 (MQ=255) tGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTCCCATAACGATGGATCAACATAGTTTTGGTaa > 1:3900723/1‑71 (MQ=255) tGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTCCCATAACGATGGATCAACATAGTTTTGGTaa > 1:4158229/1‑71 (MQ=255) gAGGTTGTATGCCAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTCCCATAACGATGTATCAACATAGTTTTGGTAAt > 1:101566/1‑71 (MQ=255) gAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTCCCa > 1:3663889/1‑42 (MQ=255) gAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTCCCa > 1:1342699/1‑42 (MQ=255) gAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTCCCa > 1:3305245/1‑42 (MQ=255) gAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTCCCa > 1:532712/1‑42 (MQ=255) gAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTCCCATAACGATGGATCAACATAGTTTTGGTaa < 1:605551/70‑1 (MQ=255) gAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTCCCATAACGATGGATCAACATAGTTTTGGTAAt > 1:1014284/1‑71 (MQ=255) gAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTCCCATAACGATGGATCAACATAGTTTTGGTAAt > 1:178161/1‑71 (MQ=255) | ATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCACTATGATATCCGTTGAGGTTGTATGACAACATGGCCGCATTAATGCCGTTTTCCCATAACGATGGATCAACATAGTTTTGGTAAT > minE/139550‑139688 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |