| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 2120881 | 99 (1.560) | 7 (0.120) | 3/94 | NT | 7.1% | intergenic (+5/‑15) | yraN/yraO | conserved hypothetical protein/DnaA initiator‑associating factor for replication initiation |
| ? | minE | = 2120914 | 91 (1.530) | coding (19/591 nt) | yraO | DnaA initiator‑associating factor for replication initiation | |||||
GCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > minE/2120820‑2120881‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATC < minE/2120914‑2120846 gaCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAG > 1:2903269/3‑62GCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAG > 1:294957/1‑62 GATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCT < 1:474691/71‑1 GATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCT < 1:425729/71‑1 GATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCT < 1:1955518/71‑1 ATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCT < 1:1583829/70‑1 TTTAATGACCACTCATAATTAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAA < 1:2464994/54‑1 TAATGACCACTCATAATTAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAAC > 1:2427118/1‑54 TAATGACCACTCATAATTAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAAC > 1:2513524/1‑54 AGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATC > 1:1415916/1‑71 AGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATC < 1:1434152/71‑1 AGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATC > 1:1284983/1‑71 AGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTA < 1:1860138/43‑1 AGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTA < 1:1555038/43‑1 AGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTA < 1:3416542/43‑1 AGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTA < 1:3687210/43‑1 AGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTA < 1:3737883/43‑1 AGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTA < 1:846101/43‑1 AGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTA < 1:926631/43‑1 GCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > minE/2120820‑2120881‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATC < minE/2120914‑2120846 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |