| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 2120881 | 99 (1.560) | 7 (0.120) | 3/94 | NT | 7.1% | intergenic (+5/‑15) | yraN/yraO | conserved hypothetical protein/DnaA initiator‑associating factor for replication initiation |
| ? | minE | = 2120914 | 91 (1.530) | coding (19/591 nt) | yraO | DnaA initiator‑associating factor for replication initiation | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
ATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGG > minE/2120812‑2120950 | aTGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAgg < 1:2766717/71‑1 (MQ=255)aTGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAgg < 1:313245/71‑1 (MQ=255) tgGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGttt < 1:3163883/71‑1 (MQ=255) gacttCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAG > 1:2903269‑M1/3‑62 (MQ=255) ccTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGAt < 1:1150469/71‑1 (MQ=255) ccTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGAt < 1:1926005/71‑1 (MQ=255) cACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTa < 1:3570863/69‑1 (MQ=255) gggAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTg > 1:676933/1‑70 (MQ=255) ggAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGc > 1:1853730/1‑70 (MQ=255) ggAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGc > 1:3858647/1‑70 (MQ=255) aTGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCaaga < 1:3713178/71‑1 (MQ=255) aTGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCaaga < 1:2957355/71‑1 (MQ=255) aTGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCaaga < 1:1715618/71‑1 (MQ=255) tGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCaagaa < 1:1449840/71‑1 (MQ=255) ggATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTaa < 1:1845522/43‑1 (MQ=255) ggATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTaa < 1:3706363/43‑1 (MQ=255) gATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGgtttaattctttcttgcacgctaatccttaaacct < 1:425729‑M1/71‑36 (MQ=255) gATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGgtttaattctttcttgcacgctaatccttaaacct < 1:474691‑M1/71‑36 (MQ=255) gATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGgtttaattctttcttgcacgctaatccttaaacct < 1:1955518‑M1/71‑36 (MQ=255) gATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCg > 1:1582087/1‑51 (MQ=255) gATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCg > 1:2552084/1‑51 (MQ=255) gATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCg > 1:2185637/1‑51 (MQ=255) gATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCaagaa > 1:2076990/1‑59 (MQ=255) gATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGct < 1:1434152‑M2/71‑3 (MQ=255) gATTAAGGATGCATTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCg > 1:2215022/1‑51 (MQ=255) tAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCaagaaag < 1:218642/58‑1 (MQ=255) tAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAg > 1:2936321/1‑66 (MQ=255) tAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAg > 1:2519550/1‑66 (MQ=255) tAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAg > 1:1341236/1‑66 (MQ=255) tAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAg > 1:2375287/1‑66 (MQ=255) tAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAg > 1:2660902/1‑66 (MQ=255) tAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAg > 1:3577828/1‑66 (MQ=255) tAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAg > 1:1570186/1‑66 (MQ=255) aaGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAgcttgct > 1:3485871/1‑71 (MQ=255) aGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAagaaagaa > 1:512431/1‑58 (MQ=255) aGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAgcttgctt < 1:1929434/71‑1 (MQ=255) aGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAgcttgctt < 1:758180/71‑1 (MQ=255) aGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAgcttgctt < 1:1851850/71‑1 (MQ=255) aGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAgcttgctt < 1:2573574/71‑1 (MQ=255) tttAATGACCACTCATAATTAAGctttaattctttcttgcacgctaatccttaa < 1:2464994‑M1/54‑32 (MQ=255) tttAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCaagaa < 1:2950400/46‑1 (MQ=255) tttAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCaagaa < 1:835186/46‑1 (MQ=255) tttAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCaagaa < 1:1166001/46‑1 (MQ=255) ttAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAg > 1:3138413/1‑71 (MQ=255) ttAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAg > 1:4127575/1‑71 (MQ=255) tAATGACCACTCATAATTAAGctttaattctttcttgcacgctaatccttaaac > 1:2513524‑M1/1‑21 (MQ=255) tAATGACCACTCATAATTAAGctttaattctttcttgcacgctaatccttaaac > 1:2427118‑M1/1‑21 (MQ=255) tAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGTTTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAg < 1:2887828/70‑1 (MQ=255) tAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGaaa > 1:3554469/1‑69 (MQ=255) tAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGaaa > 1:2527587/1‑69 (MQ=255) tAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGaaa > 1:2412127/1‑69 (MQ=255) tAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGaaa > 1:2080476/1‑69 (MQ=255) tAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAg < 1:1393242/70‑1 (MQ=255) tAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAg > 1:705077/1‑70 (MQ=255) tAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAg < 1:1557595/70‑1 (MQ=255) tAATCACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAg < 1:2264629/70‑1 (MQ=255) aaTGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCa > 1:4245612/1‑62 (MQ=255) aaTGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCa > 1:2509992/1‑62 (MQ=255) aaTGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCa > 1:2490494/1‑62 (MQ=255) aaTGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGc < 1:964229/70‑1 (MQ=255) aaTGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGc < 1:364955/70‑1 (MQ=255) aaTGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGc < 1:3264404/70‑1 (MQ=255) aaTGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGc < 1:2845115/70‑1 (MQ=255) cTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTaa < 1:2417913/43‑1 (MQ=255) cTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTaa < 1:899037/43‑1 (MQ=255) tCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTc < 1:3462480/52‑1 (MQ=255) tCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTc < 1:485796/52‑1 (MQ=255) tCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTc < 1:3228646/52‑1 (MQ=255) tCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCa < 1:2289482/66‑1 (MQ=255) tCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCa < 1:3846498/66‑1 (MQ=255) aTAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCa < 1:2078243/70‑1 (MQ=255) aTAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCa < 1:2828374/70‑1 (MQ=255) aTAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCa < 1:65527/70‑1 (MQ=255) aTAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCa < 1:1430030/70‑1 (MQ=255) aTAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCa < 1:145045/70‑1 (MQ=255) aTAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCa > 1:1874068/1‑70 (MQ=255) aTAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCa < 1:3287001/70‑1 (MQ=255) aTAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCa < 1:3508605/70‑1 (MQ=255) aTAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCa < 1:1768155/70‑1 (MQ=255) tAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGct < 1:926631‑M2/43‑3 (MQ=255) tAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGct < 1:846101‑M2/43‑3 (MQ=255) tAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGct < 1:1860138‑M2/43‑3 (MQ=255) tAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGct < 1:1555038‑M2/43‑3 (MQ=255) aTTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAAt < 1:404648/70‑1 (MQ=255) aTTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAAt < 1:1916679/70‑1 (MQ=255) aTTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAAt < 1:1429358/70‑1 (MQ=255) aTTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAAt < 1:487599/70‑1 (MQ=255) aaGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTgcg > 1:3376526/1‑71 (MQ=255) aaGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTgc < 1:4046580/70‑1 (MQ=255) aGctttaattctttcttgcacgctaatccttaaaccttaattatgagtggtcattaaaggcatccttaatc > 1:1415916‑M1/1‑2 (MQ=255) aGctttaattctttcttgcacgctaatccttaaaccttaattatgagtggtcattaaaggcatccttaatc > 1:1284983‑M1/1‑2 (MQ=255) aGctttaattctttcttgcacgctaatccttaaaccttaatta < 1:1555038‑M1/43‑42 (MQ=255) aGctttaattctttcttgcacgctaatccttaaaccttaatta < 1:3416542‑M1/43‑42 (MQ=255) aGctttaattctttcttgcacgctaatccttaaaccttaatta < 1:846101‑M1/43‑42 (MQ=255) aGctttaattctttcttgcacgctaatccttaaaccttaatta < 1:3687210‑M1/43‑42 (MQ=255) aGctttaattctttcttgcacgctaatccttaaaccttaatta < 1:3737883‑M1/43‑42 (MQ=255) aGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAACcttaattatgagtggtcattaaaggcatccttaatc < 1:474691‑M2/71‑37 (MQ=255) aGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAACcttaattatgagtggtcattaaaggcatccttaatc < 1:1955518‑M2/71‑37 (MQ=255) aGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAACcttaattatgagtggtcattaaaggcatccttaatc < 1:425729‑M2/71‑37 (MQ=255) aGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAACcttaattatgagtggtcattaaaggcatccttaat < 1:1583829‑M2/70‑36 (MQ=255) | ATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGG > minE/2120812‑2120950 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |