| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 2738325 = | 86 (1.360) | 6 (0.140) | 3/70 | NT | 11.1% | intergenic (+99/‑430) | tufA/rpsJ | protein chain elongation factor EF‑Tu/30S ribosomal subunit protein S10 |
| ? | minE | 2738371 = | 36 (0.810) | intergenic (+145/‑384) | tufA/rpsJ | protein chain elongation factor EF‑Tu/30S ribosomal subunit protein S10 | |||||
AAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < minE/2738408‑2738325‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑attttaaatatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATTCA > minE/2738371‑2738437 AAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATAT > 1:2704707/1‑71 AAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATT > 1:3219562/1‑71 GCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAA < 1:3409206/71‑1 GCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTA > 1:4001690/1‑70 CCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAA < 1:654853/71‑1 CCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAA < 1:3137035/71‑1 TGACAAATTAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATA > 1:1509768/1‑71 TGACAAATGTAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTT > 1:2843209/1‑66 TGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTT > 1:4202676/1‑66 TGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTT > 1:2410644/1‑65 ACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATAT > 1:2998650/1‑70 TGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTA < 1:1311246/60‑1 TTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAA < 1:2321481/54‑1 TTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAA < 1:2408511/54‑1 TTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAA < 1:2000475/54‑1 TTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAA < 1:485845/54‑1 CAGAAAGATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAA > 1:543908/1‑46 CAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAA > 1:1771240/1‑46 CAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAA > 1:4237070/1‑46 CAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAA > 1:58799/1‑46 CAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAA > 1:1974611/1‑46 CAGAAACATTAATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAA > 1:4223732/1‑46 CATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTA < 1:1930917/38‑1 CATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTA < 1:3171744/38‑1 TTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTA < 1:1935845/36‑1 CATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGT > 1:2991016/1‑71 GTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCT < 1:274191/65‑1 TAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTT > 1:531052/1‑65 TAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTT > 1:3470435/1‑65 TAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTT > 1:1373072/1‑65 TAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTT > 1:3889061/1‑65 ATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATG > 1:3536085/1‑67 TTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGC < 1:4150395/47‑1 TTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGG < 1:3566443/44‑1 TTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGG < 1:3843615/44‑1 TTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGG < 1:1943956/44‑1 AATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTT < 1:2151325/70‑1 AATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTT < 1:603546/70‑1 AATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTA > 1:3508067/1‑58 AATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTA > 1:1014371/1‑58 AATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTA > 1:908611/1‑58 TATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAAT > 1:1611066/1‑71 TGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATT < 1:487999/70‑1 TGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTT < 1:144559/47‑1 AATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATTCA < 1:3667811/70‑1 AATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATTCA < 1:3595597/70‑1 AATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATTCA < 1:3369253/70‑1 AAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < minE/2738408‑2738325‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑attttaaatatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATTCA > minE/2738371‑2738437 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |