| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 2738325 = | 86 (1.360) | 6 (0.140) | 3/70 | NT | 11.1% | intergenic (+99/‑430) | tufA/rpsJ | protein chain elongation factor EF‑Tu/30S ribosomal subunit protein S10 |
| ? | minE | 2738371 = | 36 (0.810) | intergenic (+145/‑384) | tufA/rpsJ | protein chain elongation factor EF‑Tu/30S ribosomal subunit protein S10 | |||||
GTACTGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATTCA > minE/2738303‑2738437 | gTACTGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGtt < 1:3200760/71‑1 (MQ=255)gTACTGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGt < 1:1141185/70‑1 (MQ=255)gTACTGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGt < 1:1656339/70‑1 (MQ=255) aCTGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTc > 1:1049443/1‑71 (MQ=255) tCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTg < 1:425492/69‑1 (MQ=255) tCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTg < 1:1479665/69‑1 (MQ=255) cAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGttt > 1:1034738/1‑71 (MQ=255) aGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGtttt < 1:2423250/71‑1 (MQ=255) gAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGtttt > 1:1205215/1‑70 (MQ=255) aaCGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGATTGTTTCTGttttt > 1:609165/1‑70 (MQ=255) aaCGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGttttt > 1:111190/1‑70 (MQ=255) aaCGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGttttt > 1:1235662/1‑70 (MQ=255) attattCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCtt < 1:3371510/70‑1 (MQ=255) attattCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCtt < 1:3102104/70‑1 (MQ=255) attattCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCtt < 1:2237371/70‑1 (MQ=255) ttattCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAAGATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCtt < 1:3936469/69‑1 (MQ=255) ttattCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTaaa < 1:3354370/63‑1 (MQ=255) ttattCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTaaa < 1:1475555/63‑1 (MQ=255) catatttaaaatgttaaattgaattgatattttaaatatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGt > 1:2991016‑M2/44‑71 (MQ=255) ATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGt > 1:2998650‑M1/1‑70 (MQ=255) TATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTAATTTGTCa > 1:1509768‑M1/1‑71 (MQ=255) TTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATTAATGTTTCTg > 1:4223732‑M1/1‑46 (MQ=255) TTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTg > 1:4237070‑M1/1‑46 (MQ=255) TTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTg > 1:1974611‑M1/1‑46 (MQ=255) TTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTg > 1:58799‑M1/1‑46 (MQ=255) TTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTg > 1:1771240‑M1/1‑46 (MQ=255) TTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAgg < 1:654853‑M1/71‑1 (MQ=255) TTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAgg < 1:3137035‑M1/71‑1 (MQ=255) TTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATCTTTCTg > 1:543908‑M1/1‑46 (MQ=255) TTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTaaaa < 1:485845‑M1/54‑1 (MQ=255) TTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTaaaa < 1:2321481‑M1/54‑1 (MQ=255) TTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTaaaa < 1:2000475‑M1/54‑1 (MQ=255) TTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTaaaa < 1:2408511‑M1/54‑1 (MQ=255) TTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGc < 1:3409206‑M1/71‑1 (MQ=255) TAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATg < 1:3171744‑M1/38‑1 (MQ=255) TAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATg < 1:1930917‑M1/38‑1 (MQ=255) TAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCa < 1:1311246‑M1/60‑1 (MQ=255) TAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGc > 1:4001690‑M1/1‑70 (MQ=255) AAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCa > 1:4202676‑M1/1‑66 (MQ=255) AAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTACATTTGTCa > 1:2843209‑M1/1‑66 (MQ=255) AAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCa > 1:2410644‑M1/1‑65 (MQ=255) AATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCtttt > 1:3219562‑M1/1‑71 (MQ=255) ATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCttttt > 1:2704707‑M1/1‑71 (MQ=255) gttaaattgaattgatattttaaatatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCt < 1:274191‑M2/34‑1 (MQ=255) tcaattcaatTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGt > 1:3557581/1‑58 (MQ=255) tcaattcaatTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCt > 1:2689824/1‑71 (MQ=255) tcaattcaatTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCt > 1:2545346/1‑71 (MQ=255) taaattgaattgatattttaaatatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCttt > 1:3470435‑M2/30‑65 (MQ=255) taaattgaattgatattttaaatatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCttt > 1:3889061‑M2/30‑65 (MQ=255) taaattgaattgatattttaaatatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCttt > 1:1373072‑M2/30‑65 (MQ=255) taaattgaattgatattttaaatatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCttt > 1:531052‑M2/30‑65 (MQ=255) caattcaattTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTg < 1:1379929/36‑1 (MQ=255) aattcaattTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTa < 1:2922779/71‑1 (MQ=255) caattTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTaaaa > 1:1345329/1‑40 (MQ=255) caattTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTaaa > 1:3678532/1‑39 (MQ=255) caattTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTaaa > 1:2989019/1‑39 (MQ=255) caattTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTaaa > 1:2611526/1‑39 (MQ=255) caattTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATTCTTCAtt > 1:110678/1‑49 (MQ=255) caattTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCAtt > 1:3048253/1‑49 (MQ=255) caattTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCAtt > 1:3679651/1‑49 (MQ=255) caattTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCAtt > 1:3573148/1‑49 (MQ=255) caattTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCAtt > 1:2687299/1‑49 (MQ=255) aattTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTAttttt < 1:208805/71‑1 (MQ=255) aattTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTAttttt < 1:4227409/71‑1 (MQ=255) aattTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTAttttt < 1:2334821/71‑1 (MQ=255) aattTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTAtttt < 1:1048904/70‑1 (MQ=255) aattTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTAtttt < 1:3848664/70‑1 (MQ=255) aattTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTCTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTAttttt < 1:169625/71‑1 (MQ=255) tttAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCa < 1:1953735/51‑1 (MQ=255) tttAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTaa < 1:1101576/71‑1 (MQ=255) tAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATg > 1:3893849/1‑71 (MQ=255) tAACATTTTAAATATGAATGTCTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAAt > 1:3763759/1‑70 (MQ=255) attttaaatatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATg > 1:3536085‑M2/16‑67 (MQ=255) ttttaaatatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGc < 1:4150395‑M2/33‑1 (MQ=255) ttaaatatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAgg < 1:3843615‑M2/32‑1 (MQ=255) ttaaatatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAgg < 1:1943956‑M2/32‑1 (MQ=255) ttaaatatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAgg < 1:3566443‑M2/32‑1 (MQ=255) aatatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTa > 1:908611‑M2/10‑58 (MQ=255) aatatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTa > 1:3508067‑M2/10‑58 (MQ=255) aatatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTa > 1:1014371‑M2/10‑58 (MQ=255) aatatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGtaattt < 1:2151325‑M2/61‑1 (MQ=255) aatatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGtaattt < 1:603546‑M2/61‑1 (MQ=255) tatgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGtaatttaat > 1:1611066‑M2/8‑71 (MQ=255) tgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCtt < 1:144559‑M2/42‑1 (MQ=255) tgaatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGtaatttaatt < 1:487999‑M2/65‑1 (MQ=255) aatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATTCa < 1:3667811‑M2/67‑1 (MQ=255) aatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATTCa < 1:3595597‑M2/67‑1 (MQ=255) aatGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATTCa < 1:3369253‑M2/67‑1 (MQ=255) gTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTAt < 1:2188938/44‑1 (MQ=255) gTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTAt < 1:2273137/44‑1 (MQ=255) gTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTAt < 1:884573/44‑1 (MQ=255) | GTACTGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATTCA > minE/2738303‑2738437 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |